四個地理品系褶皺臂尾輪蟲Brachionus plicatilis的RAPD分析.pdf

1、該文采用隨機(jī)擴(kuò)增多態(tài)性DNA(RAPD)技術(shù)對四個地理品系的褶皺臂尾輪蟲(Brachionus plicatilis)種群的遺傳多樣性進(jìn)行了研究.四個地理品系分別為大連、盤錦、東營、天津.實驗樣品的來源為野外采集輪蟲卵進(jìn)行實驗室培養(yǎng)獲得新鮮的輪蟲樣品,用酚-氯仿抽提法獲得DNA,在優(yōu)化的RAPD反應(yīng)條件下,即94℃預(yù)變性5min,然后進(jìn)入PCR循環(huán):94℃變性1min,36℃退火1min,72℃延伸1min;共45個循環(huán)后,在72℃延伸

2、10min.該文隨機(jī)選定了30個10bp的引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增,其中26條引物所得的擴(kuò)增帶帶型清晰而且重復(fù)性好.將這26條隨機(jī)引物產(chǎn)生的譜帶進(jìn)行DNA多態(tài)性分析,26條引物共檢測出311個位點,片段長度在190-2000bp.大連品系輪蟲種群產(chǎn)生226個位點,其中有196個多態(tài)性標(biāo)記;盤錦品系產(chǎn)生165個位點,其中有150個多態(tài)性標(biāo)記;東營品系產(chǎn)生207個位點,其中有182個多態(tài)性標(biāo)記;天津品系產(chǎn)生180個位點,其中有153個多態(tài)性標(biāo)記.

3、四個品系之間的共享度分別為:大連與盤錦品系的共享度為0.3826,大連與東營品系的共享度為0.3467,大連與天津品系的共享度為0.3447--為共享度最小的兩個品系;盤錦與天津品系的共享度最大為0.4069.四個品系的Nei遺傳距離由小到大分別為:天津與盤錦品系為0.4215,天津與東營品系之間為0.4465;盤錦與東營品系之間為0.4498;大連與盤錦品系之間為0.4660;大連與東營品系之間為0.4852;大連與天津品系之間為0.