連云港市結核桿菌分子分型及其與臨床特征的關聯研究.pdf

1、背景與目的:結核病是由結核桿菌感染引起的慢性傳染性疾病。世界衛(wèi)生組織2016年全球結核病報告顯示，2015年全球新發(fā)結核病例1040萬，140萬人因結核病死亡。中國是結核病高負擔國家，病例數僅次于印度和印度尼西亞，位居第三。我國結核病疫情存在高感染率、高患病率、高耐藥率、高復發(fā)率、低發(fā)現率的特點。
　　傳統(tǒng)的流行病學研究方法在確認結核病傳染源及傳播規(guī)律方面往往存在局限性，而分子流行病學的發(fā)展則為結核病研究提供了有力武器，能夠有效追

2、蹤傳染源、發(fā)現結核桿菌傳播規(guī)律、識別重點人群，為結核病防治工作提供科學依據。
　　本次研究運用分子流行病學方法對連云港市傳染性肺結核病人臨床分離株進行基因分型，探討其遺傳多樣性、菌株成簇性及其與臨床特征等因素的關聯性，分析成簇菌株的地理位置分布及系統(tǒng)進化特點，為連云港市結核病防治提供科學依據。
　　方法:本研究選擇江蘇省連云港市為研究現場，以2013～2014年新診斷的痰培養(yǎng)陽性結核病患者為研究對象，收集人口學特征、臨床資料

3、、診治經過等信息。本次研究包括兩個部分。第一部分采用數目可變串聯重復序列-結核桿菌散在重復單位(variable number tandem repeats-mycobacterial interspersed repetitive units,VNTR-MIRU)15位點組合方法對結核桿菌臨床分離株進行分子分型，探討其遺傳多樣性和特異指紋圖譜，分析連云港市結核病傳播規(guī)律及與臨床特征的關聯。VNTR-MIRU位點組合對菌株分辨力的判斷采

4、用Hunter-Gaston指數(Hunter-Gaston discriminatory index，HGDI)表示。第二部分在結核桿菌分子分型的基礎上，采用R語言pheatmap軟件包對數字化分型結果進行聚類分析，運用BioNumerics7.0軟件構建最小生成樹，開展成簇性分析，并探討菌株成簇性影響因素。成簇風險分析采用Logistic回歸模型，并用比值比(OR)及其95％可信區(qū)間(CI)表示。
　　結果:(1)對742株菌

5、株采用15位點VNTR-MIRU基因分型，結果顯示，總分辨力HGDI值為0.99998，其中遺傳多樣性最高的是Qub11b位點，h=0.763，遺傳多樣性最小的位點為ETRC，h=0.037。(2)成簇性分析發(fā)現菌株共聚成643個類，其中未成簇而形成的“唯一”類的共597個，145例成簇菌株形成46個簇，成簇比例為19.54％。成簇菌株中形成較大簇（所含菌株例數≥5例）的菌株比例為35.17％。將較大簇菌株病例的居住位置在地圖上標注后，

6、呈現一定的地區(qū)聚集性，南北部均有特定基因型菌株聚集，大部分成簇菌株沿主干交通線分布。(3)菌株成簇性影響因素分析發(fā)現，職業(yè)、治療結局等與菌株成簇性的關聯具有統(tǒng)計學意義，非農民職業(yè)的患者感染株表現出更高的成簇風險(調整OR=2.35，95％CI:1.33-4.15，P=0.003)，不良治療結局的患者表現出較高的成簇風險（調整OR=1.85，95％CI:1.00-3.45，P=0.050）。(4)對連云港市結核桿菌流行株構建最小生成樹分析