α-氨基酸NCA-NTA開(kāi)環(huán)機(jī)理的量子化學(xué)計(jì)算.pdf_第1頁(yè)
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1、聚肽和聚類肽都是由α-氨基酸通過(guò)肽鍵(酰胺鍵)連接而形成的聚合物,由于其極佳的生物相容性、生物可降解性,有望能夠廣泛地應(yīng)用在生物醫(yī)藥領(lǐng)域、組織工程領(lǐng)域、生物材料領(lǐng)域等。α-氨基酸-N-羧酸酐(α-amino acidN-carboxyanhydride,NCA)開(kāi)環(huán)聚合法以及N-硫代羧酸酐(N-thiocarboxyanhydride,NTA)開(kāi)環(huán)聚合法是目前制備聚肽和聚類肽最具前景的方法。在過(guò)去的一個(gè)世紀(jì)中,科學(xué)家研究了多種機(jī)理以制備

2、分子量可控、組分及序列可控、分子量分布窄和具備多樣拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)的聚肽及聚類肽。其中常規(guī)胺引發(fā)機(jī)理(normal amine mechanism,NAM)是非常有效且被廣泛接受的機(jī)理。然而由于NCA活性高且對(duì)濕度敏感,使得其反應(yīng)必須在極為苛刻的條件下進(jìn)行,聚合過(guò)程的中間體和過(guò)渡態(tài)很難甚至不可能被分離得到,對(duì)其機(jī)理的解釋都基于假設(shè)和間接證據(jù)。該機(jī)理的決速步是否為脫羧過(guò)程也因此一直飽受爭(zhēng)議。NTA由于其穩(wěn)定性非常好,在制備大分子量的聚肽、聚類肽上

3、又有顯著挑戰(zhàn),對(duì)其研究才剛剛起步。因此,根據(jù)目前的技術(shù)條件從實(shí)驗(yàn)上直接研究NAM機(jī)理的細(xì)節(jié)十分困難。
  量子化學(xué)計(jì)算現(xiàn)已發(fā)展成為揭示化學(xué)反應(yīng)本質(zhì)的強(qiáng)有力工具,先后有兩次諾貝爾獎(jiǎng)被授予研究該領(lǐng)域的科學(xué)家。其可靠性和高效性已經(jīng)被廣泛認(rèn)可。我們采用量子化學(xué)中的B3LYP/6-31G(d,p)、B3LYP/Midix和MP2/6-31G(d,p)方法研究了伯胺、仲胺、帶有吸電基團(tuán)的仲胺引發(fā)L-丙氨酸-NCA(L-alanine-NCA,

4、Ala-NCA)的開(kāi)環(huán)聚合,發(fā)現(xiàn)仲胺和伯胺引發(fā)AIa-NCA開(kāi)環(huán)聚合的能力近乎相同,且決速步均為胺加成過(guò)程。帶有吸電基團(tuán)的仲胺由于其親核性降低,對(duì)Ala-NCA的引發(fā)能力顯著降低。我們研究了伯胺、仲胺引發(fā)N-取代甘氨酸-N-羧酸酐(N-substituted glycineN-carboxyanhydride,NNCA)的開(kāi)環(huán)聚合,發(fā)現(xiàn)伯胺和仲胺引發(fā)能力近乎相同,決速步為胺加成過(guò)程,其結(jié)論與前者完全一致。我們用CCSD(T)-6-311

5、G(d,p)方法對(duì)上述四條反應(yīng)路徑做高精度能量計(jì)算并結(jié)合其他三種方法的數(shù)據(jù)進(jìn)行分析,發(fā)現(xiàn)NCA和NNCA之間可能進(jìn)行活性無(wú)規(guī)共聚。進(jìn)一步地,我們研究了伯胺和仲胺引發(fā)C4原子上具有不同取代基的NCA,發(fā)現(xiàn)取代基的不同并不會(huì)對(duì)化學(xué)反應(yīng)路徑產(chǎn)生明顯的改變,決速步依然是胺加成過(guò)程。為了更加貼近實(shí)驗(yàn)現(xiàn)象,我們引入溶劑化效應(yīng)研究伯胺、仲胺引發(fā)NCA及NNCA開(kāi)環(huán)聚合機(jī)理,發(fā)現(xiàn)溶劑化效應(yīng)并不會(huì)改變決速步?;瘜W(xué)反應(yīng)體系中,胺類并不會(huì)只按照一個(gè)方向進(jìn)攻N

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