關(guān)于有序性狀位點(diǎn)基因定位的再研究.pdf

1、近年來，隨著統(tǒng)計(jì)遺傳學(xué)的迅猛發(fā)展，人們對尋找合適的定位多個(gè)QTL的統(tǒng)計(jì)方法的關(guān)注度越來越高.多區(qū)間定位(MIM)法是一種可以同時(shí)定位多個(gè)QTL與估計(jì)上位性的方法，但是這種方法通常都是針對連續(xù)分布的性狀進(jìn)行研究與應(yīng)用的.有序性狀的數(shù)據(jù)承載的信息相對較少，因此定位有序性狀的QTL更為復(fù)雜.由于這種特殊性，選擇合適的統(tǒng)計(jì)學(xué)方法把性狀分布考慮在內(nèi)對于定位QTL，尤其是多個(gè)QTL十分重要.
　　本文中，我們在關(guān)于有序性狀基因定位的研究中考慮

2、多區(qū)間定位法，假設(shè)存在一個(gè)叫易患性的潛在響應(yīng)變量，通過閾值模型將它和有序數(shù)據(jù)聯(lián)系起來，再通過遺傳和統(tǒng)計(jì)模型把易患性和QTL基因型聯(lián)系起來，最終建立起一個(gè)表達(dá)有序數(shù)據(jù)和QTL基因型之間關(guān)系的累積logistic回歸模型.然而，對于這種QTL的區(qū)間定位問題，大多利用的都是全基因組掃描的方法.為使區(qū)間定位更加簡單直接，我們將重組率看作未知參數(shù)，通過EM算法同時(shí)獲得QTL位置參數(shù)、閾值模型參數(shù)及QTL效應(yīng)參數(shù)的估計(jì)值.本文根據(jù)干擾系數(shù)的不同情況