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文檔簡介
1、智能可以看作是知識(shí)積累和知識(shí)運(yùn)用的綜合能力反應(yīng),主要是認(rèn)識(shí)客觀事物、掌握客觀規(guī)律,以及運(yùn)用知識(shí)去解決實(shí)際問題的能力。人工智能就是用人工系統(tǒng)來模擬人的問題求解、推理、學(xué)習(xí)等方面的能力。人工智能經(jīng)過近半個(gè)世紀(jì)的發(fā)展,形成了多個(gè)研究發(fā)展方向,其中智能計(jì)算方法是智能科學(xué)當(dāng)前研究的重要方向之一。在過去幾十年的時(shí)間里,智能計(jì)算得到了廣泛的研究和迅猛的發(fā)展,并在信號(hào)處理、模式識(shí)別、系統(tǒng)辨識(shí)、發(fā)酵控制、生物信息學(xué)、食品和醫(yī)療以及商業(yè)等領(lǐng)域取得了豐碩的成
2、果。
本文針對(duì)智能計(jì)算方法在生物發(fā)酵過程以及生物信息學(xué)中的相關(guān)應(yīng)用進(jìn)行了研究,包括Cascaded Centralized Takagi-Sugeno-Kang(CCTSK)模糊神經(jīng)網(wǎng)絡(luò),多層感知器(Multi-Layer Perceptron)、徑向基函數(shù)(Radial Basis Function,RBF)神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)、Takagi-Sugeno-Kang(TSK)模糊系統(tǒng)等相關(guān)智能計(jì)算方法在谷胱甘肽、乳酸桿菌的發(fā)酵過程中
3、的應(yīng)用。另外,對(duì)生物信息學(xué)中基因表達(dá)調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的重構(gòu)也做了一點(diǎn)工作,具體來說,本論文的創(chuàng)造性研究成果主要有:
第一部分,對(duì)模糊系統(tǒng)進(jìn)行了研究,建立了不確定的高斯混合模型和具有可加性的二型Takagi-Sugeno-Kang模糊系統(tǒng)之間的對(duì)應(yīng)關(guān)系。然后利用Cascaded CentralizedTakagi-Sugeno-Kang(CCTSK)模糊神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)對(duì)谷胱甘肽(glutathione,GSH)的發(fā)酵過程進(jìn)行建模。在實(shí)際的
4、發(fā)酵生產(chǎn)過程中,由于菌體發(fā)酵過程自身的復(fù)雜性以及實(shí)驗(yàn)中的客觀條件的限制,使得實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)不可避免的含有一定量的噪音,從而使得傳統(tǒng)的神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)所建立的模型的收斂速度和精度明顯下降,且建模結(jié)果缺乏可解釋性。CCTSK模糊神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)由于采用了中心化的級(jí)聯(lián)的網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu),實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,運(yùn)用CCTSK模糊神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)對(duì)谷胱甘肽發(fā)酵的過程所建立的模型具有良好的魯棒性和更高的可解釋性。
第二部分,研究了魯棒的基于熵準(zhǔn)則的RBF谷胱甘肽發(fā)酵建模。利用信息
5、論中關(guān)于熵的概念,從概率密度的角度出發(fā),采用判別熵構(gòu)造出一個(gè)新的誤差準(zhǔn)則函數(shù)——基于熵準(zhǔn)則的誤差準(zhǔn)則函數(shù),并將其應(yīng)用于谷胱甘肽的發(fā)酵建模過程中。由于新的誤差準(zhǔn)則函數(shù)能夠從訓(xùn)練樣本的整體分布結(jié)構(gòu)來進(jìn)行模型的參數(shù)學(xué)習(xí),從而有效地避免了傳統(tǒng)的基于Mean Square Error(MSE)準(zhǔn)則的RBF神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的過學(xué)習(xí)和泛化能力弱的缺陷。
第三部分,進(jìn)一步研究了基于熵準(zhǔn)則的誤差準(zhǔn)則函數(shù)的特點(diǎn)。將新的準(zhǔn)則函數(shù)用于多層感知器模型、徑向
6、基函數(shù)神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)模型以及Takagi-Sugeno-Kang模糊系統(tǒng)模型中,然后對(duì)乳酸桿菌發(fā)酵生成多糖(exopolysaccharide,EPS)的過程進(jìn)行建模,實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明:新方法具有較高的預(yù)測(cè)精度、泛化能力以及良好的魯棒性。
最后一部分,研究了目前生物信息學(xué)中的熱點(diǎn)——基因表達(dá)調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的重構(gòu)問題。針對(duì)傳統(tǒng)的線性組合模型只考慮了基因之間的線性調(diào)控關(guān)系的缺陷,引入了能量因子的概念,從而使得模型具備了分析基因間的非線性調(diào)控關(guān)
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