基于支持向量機的含平面?zhèn)谓Y(jié)的RNA二級結(jié)構(gòu)預(yù)測.pdf

1、隨著人類基因組計劃實施的不斷深入，生物學(xué)的數(shù)據(jù)信息飛速增長，如何從這些海量數(shù)據(jù)中提取有用的知識，揭示這些數(shù)據(jù)所蘊含的生物學(xué)意義，是對計算機科學(xué)的巨大挑戰(zhàn)。從結(jié)構(gòu)上來挖掘生物分子在生命過程中的作用，首先要解決的問題就是結(jié)構(gòu)預(yù)測。偽結(jié)是 RNA二級結(jié)構(gòu)中最難預(yù)測的一種，目前的算法主要是對平面?zhèn)谓Y(jié)進(jìn)行預(yù)測。平面?zhèn)谓Y(jié)對RNA功能的實現(xiàn)起著關(guān)鍵的作用，對含平面?zhèn)谓Y(jié)的RNA二級結(jié)構(gòu)預(yù)測的研究具有重要的現(xiàn)實意義。
　　首先，本文針對RNA堿基的

2、預(yù)測分類問題進(jìn)行研究，給出了基于FDAGSVM的對RNA堿基進(jìn)行預(yù)測分類的算法。RNA堿基的準(zhǔn)確分類是正確預(yù)測其二級結(jié)構(gòu)的前提，該算法對決策結(jié)果進(jìn)行了模糊化處理，以計算模糊隸屬度代替取符號運算，并依據(jù)模糊隸屬度的值決定樣本在決策有向無環(huán)圖中的路徑。
　　其次，針對利用E-NSSEL標(biāo)識序列恢復(fù)RNA二級結(jié)構(gòu)過程中堿基的編碼問題，本文提出了一種把 RNA序列中可能配對的兩個堿基看作為一個整體進(jìn)行編碼的方法。先將一個堿基的局部環(huán)境模式