2023年全國碩士研究生考試考研英語一試題真題(含答案詳解+作文范文)_第1頁
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文檔簡介

1、系統(tǒng)發(fā)生樹是描述物種進化順序和進化關系的一種拓撲結(jié)構。一個可靠的系統(tǒng)發(fā)生的推斷,將揭示出有關生物進化過程的順序,有助于我們了解生物進化的歷史和進化機制。
  發(fā)生樹的構建問題是一個NP完全問題,因此,研究構造發(fā)生樹的近似最優(yōu)算法有著重要意義。目前常用的構建發(fā)生樹的方法有三種,即距離法、最大簡約法和最大似然法。
  本文對距離法中的鄰接法進行了三點改進:1.使用更精確的進化模型來度量序列之間的距離,降低因模型而帶來的誤差;2.

2、通過隊列產(chǎn)生多個拓撲結(jié)構,解決了鄰接法只能產(chǎn)生一個拓撲結(jié)構的缺陷;3.引入回退機制,消除了距離法中負枝長的產(chǎn)生,得到的樹更準確。
  對最大簡約法,引入遺傳算法的思想,提出了一種新的建樹算法,即遺傳簡約法,以簡約樹長作為適應值函數(shù),隨機生成多個初始樹,逐步收斂到所要搜尋的解,即最大簡約樹。
  對最大似然法,改進了一種新的啟發(fā)式搜索:隨機建立一棵初始樹,然后通過查看與當前最優(yōu)樹拓撲最近的樹,從中尋找更優(yōu)樹,不斷地更新當前最優(yōu)

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