Has-miR-150及其潛在靶向調(diào)控的紅細(xì)胞膜蛋白的生物信息學(xué)挖掘.pdf

1、紅系發(fā)育是一個(gè)高度有序的過(guò)程，紅系分化發(fā)生了包括細(xì)胞膜蛋白組成成份和構(gòu)造的改變?cè)趦?nèi)的一系列巨大的變化，紅細(xì)胞膜蛋白結(jié)構(gòu)和功能的穩(wěn)定性是成熟紅細(xì)胞維持形變能力和穩(wěn)定性的必備元件。紅細(xì)胞膜蛋白在生成的過(guò)程受到多層次、多因素的調(diào)控。miRNA是一種非蛋白質(zhì)的新型基因表達(dá)調(diào)控因子，為內(nèi)源性非編碼小分子RNA（18-25個(gè)核苷酸），通過(guò)結(jié)合到靶分子mRNA的3'UTR，引起靶分子mRNA的降解或翻譯抑制導(dǎo)致目的蛋白表達(dá)減少。本文通過(guò)對(duì)has-mi

2、R-150的生物信息學(xué)分析并篩選發(fā)現(xiàn)5種紅系膜骨架蛋白共6種編碼基因均是has-miR-150的可能靶標(biāo)，包括SLC4A1(band3)、EPB41(4.1R)、ANK1(ankyrin R)、GYPC(GPC)、SPTA1(α-spectrin)和SPTB(β-spectrin)等，這些基因3'UTR均含有has-miR-150預(yù)測(cè)靶點(diǎn);進(jìn)一步利用各種線上線下軟件對(duì)這些紅細(xì)胞膜蛋白的編碼基因、理化性質(zhì)、跨膜結(jié)構(gòu)、氨基酸修飾情況、二級(jí)和

3、三級(jí)結(jié)構(gòu)等進(jìn)行了分析。為進(jìn)一步通過(guò)實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證has-miR-150與這些基因的靶向關(guān)系提供了生物信息學(xué)數(shù)據(jù)。紅細(xì)胞膜蛋白分子結(jié)構(gòu)最新模型認(rèn)為spectrin四聚體構(gòu)成紅細(xì)胞基礎(chǔ)骨架，此骨架一蛋白位點(diǎn)通過(guò)與膜蛋白4.1R、Band3和GPC結(jié)合，另一蛋白位點(diǎn)通過(guò)與膜蛋白ankyrin R、Band3結(jié)合，形成4.1R復(fù)合物和Band3復(fù)合物。has-miR-150能夠同時(shí)靶向調(diào)控這群蛋白，體現(xiàn)了has-miR-150在紅細(xì)胞膜蛋白生成中發(fā)揮