用ISSR和SSR標記分析海南普通野生稻遺傳多樣性.pdf

1、遺傳多樣性是生物多樣性的核心，對瀕危和稀有物種的遺傳多樣性進行研究，可為其保護和開發(fā)利用提供科學依據(jù)。普通野生稻是普通栽培稻的祖先，是栽培稻最近緣的野生種，是水稻遺傳改良的重要種質(zhì)資源。本研究利用ISSR和SSR兩種分子標記對海南地理分布、生態(tài)類型有代表性的萬寧、文昌、瓊海、儋州、東方、澄邁6個普通野生稻天然居群進行了研究，旨在從分子水平揭示海南普通野生稻不同居群之間的遺傳多樣性和遺傳結構，擬為海南野生稻的保護和開發(fā)利用提供科學依據(jù)和理

2、論指導。本研究在分析普通野生稻居群遺傳多樣性時，對采用ISSR和SSR兩種分子標記的分析結果的差異性和相關性進行了分析。研究主要結果如下： 1)獲得海南普通野生稻ISSR-PCR最佳反應體系和最適反應程序。 2)海南普通野生稻具有較高的遺傳多樣性。ISSR和SSR兩種分子標記都表明：供試的6個居群中，萬寧居群(WN)的遺傳多樣性最高，文昌居群(WC)的遺傳多樣性最低。6個居群按遺傳多樣性從大到小順序排列為：萬寧居群(WN

3、)＞澄邁居群(CM)＞瓊海居群(QH)＞東方居群(DF)＞儋州居群(DZ)＞文昌居群(WC)。 3)海南普通野生稻居群遺傳結構與居群間遺傳分化明顯。 4)聚類分析結果表明：遺傳相似系數(shù)大約在0.68(ISSR)或0.84(SSR)時，6個居群分別聚為6組，每一個居群所有的樣本都聚在一起，而且居群間沒有任何交叉。當相似系數(shù)逐漸降低時，各居群之間的遺傳關系更加明確，居群WC與CM最先聚為一大組；居群DZ與DF先聚集為一組，然

4、后與WN聚集為一小組，之后再與QH聚集為一大組。當相似系數(shù)為0.58(ISSR)或0.65(SSR)時，所有6個居群合并在一起，說明各居群之間的遺傳分化程度不高，也許屬于同一起源。 5)利用Mantel檢測對基于這兩種標記的樣品遺傳相似性系數(shù)矩陣進行了相關分析，結果表明，ISSR和SSR標記檢測的海南普通野生稻總群體的相關系數(shù)r=0.8634，t=93.67，相關性較高。 6)根據(jù)對各居群的遺傳多樣性比較和實地考察結果，