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文檔簡介
1、槳角蚜小蜂屬和食蚧蚜小蜂屬寄生蜂分別是粉虱和介殼蟲的重要寄生蜂,個體微小,傳統(tǒng)形態(tài)分類鑒定比較困難。本論文基于核糖體28S rDNA,線粒體COⅠ基因序列,28S rNDA和COⅠ聯(lián)合基因序列對槳角蚜小蜂屬和食蚧蚜小蜂屬的部分種類進行了系統(tǒng)發(fā)育研究。采用不破壞標本的方法提取DNA,PCR擴增產物并對核糖體28S rDNA和線粒體COⅠ基因序列進行測序,以花翅蚜小蜂Marietta montana作為外群,采用ClustalX(versi
2、on1.83)、MEGA6.05、PAUP4.0、MrModeltest2.3、DAMBE、MrBayes3.2等軟件對基因序列進行處理分析,結果采用鄰接法(NJ)、最大似然法(ML)、貝葉斯法(BI)構建系統(tǒng)發(fā)育樹,得出以下結論:
1.槳角蚜小蜂28S rDNA基因序列的G+C的堿基含量60.3%(不含外群),高于A+T的堿基含量39.7%,表現(xiàn)出明顯的G+C的堿基偏向性;COⅠ基因序列A+T的堿基含量76.2%,明顯高于G
3、+C的堿基含量23.8%,表現(xiàn)出明顯的A+T的堿基偏向性,所以核基因28S rDNA與線粒體COⅠ基因的堿基構成有明顯的區(qū)別;28S rDNA和COⅠ聯(lián)合基因序列A+T的堿基含量56.5%,高于G+C的堿基含量43.5%,表現(xiàn)出A+T的堿基偏向性。食蚧蚜小蜂的28S rDNA基因序列的G+C的堿基含量58.8%,高于A+T的堿基含量41.2%,表現(xiàn)出G+C的堿基偏向性;COⅠ基因序列的A+T的堿基含量70.4%,明顯高于G+C的堿基含量
4、29.6%,表現(xiàn)出明顯的A+T的堿基偏向性;28S rDNA和COⅠ聯(lián)合基因序列的G+C的堿基含量51.6%,高于A+T的堿基含量48.4%,表現(xiàn)出略微的G+C堿基偏向性。所以食蚧蚜小蜂的核基因28S rDNA與線粒體基因的堿基構成也存在明顯的區(qū)別。
2.槳角蚜小蜂28S rDNA的轉換的頻率是顛換的1.73倍(不含外群),轉換大于顛換,轉換主要發(fā)生在T與C之間,顛換主要發(fā)生在T與G之間;COⅠ的轉換的頻率是顛換的0.60倍,
5、轉換小于顛換,轉換的發(fā)生主要在T與C之間,顛換的發(fā)生主要在T與A之間;28S rDNA和COⅠ聯(lián)合基因序列的轉換的頻率是顛換的1.01倍,即轉換與顛換的頻率幾乎一致。食蚧蚜小蜂28S rDNA的轉換的頻率是顛換的1.25倍,轉換大于顛換,轉換的發(fā)生主要在T與C之間,顛換的發(fā)生主要在A與T之間;COⅠ的轉換的頻率是顛換的0.44倍,轉換明顯小于顛換,轉換的發(fā)生主要在A與G之間,顛換的發(fā)生主要在T與A之間;28S rDNA和COⅠ聯(lián)合基因序
6、列轉換的頻率是顛換的0.93倍,轉換的發(fā)生主要在C與T之間,顛換的發(fā)生主要在T與A之間。
3.槳角蚜小蜂的28S rDNA的遺傳距離在0.000-0.098之間,COⅠ基因的遺傳距離在0.000-0.156之間,28S rDNA和COⅠ聯(lián)合基因序列的遺傳距離在0.001-0.124之間,序列之間相當保守。食蚧蚜小蜂的28S rDNA的遺傳距離在0.000-0.183之間,COⅠ基因的遺傳距離在0.000-0.173之間,28S
7、 rDNA和COⅠ聯(lián)合基因序列的遺傳距離在0.000-0.162之間,序列之間也是很保守的。
4.在DAMBE進行的堿基替換飽和性檢測各類數據均未達到飽和,說明可以重建系統(tǒng)發(fā)育樹。槳角蚜小蜂屬和食蚧蚜小蜂屬的基于28S rDNA基因序列構建的三種系統(tǒng)樹拓撲結構基本一致,基于COⅠ基因序列構建的三種樹的拓撲結構存在差別,槳角蚜小蜂屬的系統(tǒng)樹的拓撲結構的差別主要是 Eretmocerus portoricensis的聚類位置不同,
8、而食蚧蚜小蜂屬的系統(tǒng)樹的差別是Coccophagus sp.的聚類位置不同。
本研究結合形態(tài)特征和基于28S rDNA基因序列、線粒體COⅠ序列、28S rNDA和COⅠ聯(lián)合基因序列的分子手段綜合分析槳角蚜小蜂屬和食蚧蚜小蜂屬的系統(tǒng)發(fā)育關系,旨在為傳統(tǒng)形態(tài)分類提供分子依據。本研究中槳角蚜小蜂屬的NJ樹和BI樹將各物種完全分開,并且在各樹中基于28S rDNA和COⅠ聯(lián)合基因序列構建的系統(tǒng)樹置信值高于這兩種基因序列分別構建的系統(tǒng)
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