恩蚜小蜂屬部分種類DNA條形碼的構(gòu)建及系統(tǒng)發(fā)育研究.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、恩蚜小蜂屬是蚜小蜂科中種類最多的一個屬,其大部分種類是粉虱和介殼蟲的寄生蜂,在害蟲生物防治中發(fā)揮重要作用。恩蚜小蜂屬個體較小,玻片標(biāo)本制作難度較大,利用傳統(tǒng)形態(tài)特征進行分類和系統(tǒng)發(fā)育分析變得較為困難。
  DNA條形碼技術(shù)作為一項新興的物種鑒定技術(shù),已受到廣泛關(guān)注。本論文應(yīng)用DNA條形碼技術(shù)對17種恩蚜小蜂進行了分子鑒定和系統(tǒng)發(fā)育研究,驗證了DNA條形碼用于恩蚜小蜂種類鑒定和系統(tǒng)發(fā)育研究的有效性。
  首先對各地采集的恩蚜小

2、蜂種類進行形態(tài)分類及特征描述,并以黃蚜小蜂屬的代表種為外群,基于28SrDNA、COI及二者的合并數(shù)據(jù)集28SrDNA&COI,采取相鄰連接法、最小進化法、最大似然法構(gòu)建了恩蚜小蜂屬的系統(tǒng)發(fā)育樹。通過分析得出如下結(jié)果:
  1.28SrDNA和COI兩個基因位點被應(yīng)用于17種恩蚜小蜂32個個體的序列分析及系統(tǒng)發(fā)育研究。由于部分個體不能用通用引物成功的擴增,本文設(shè)計出恩蚜小蜂屬28SrDNA和COI的特異性引物。由測序結(jié)果及 BLA

3、ST搜索結(jié)果顯示,28SrDNA和COI基因可以用來區(qū)分所研究的恩蚜小蜂種類,因此28SrDNA和COI基因是特異性良好的DNA條形碼標(biāo)記基因。
  2.恩蚜小蜂屬28SrDNA序列的保守位點為3,占總位點數(shù)的0.55%;序列變異位點為538,占總變異位點的99.4%;簡約信息位點為536,占序列總位點的99.1%;A+T的堿基含量為43.5%,低于C+G的堿基含量(56.5%)。轉(zhuǎn)換數(shù)為113,顛換數(shù)為237,堿基的轉(zhuǎn)換主要發(fā)生

4、在TC間,轉(zhuǎn)換的頻率是顛換頻率的0.48倍,由此可以認(rèn)為恩蚜小蜂屬的28SrDNA的保守性較強。經(jīng)分析堿基替換飽和性和P距離-R的關(guān)系,可知28SrDNA序列的系統(tǒng)發(fā)育信號較強。
  3.恩蚜小蜂屬COI序列的保守位點為1,占總位點數(shù)的0.15%;序列變異位點為680,占總變異位點的99.7%;簡約信息位點為678,占序列總位點的99.4%;A+T的堿基含量為77.2%,遠(yuǎn)高于C+G的堿基含量(22.8%)。其中轉(zhuǎn)換數(shù)為99,顛換

5、數(shù)為284,堿基的顛換主要發(fā)生在AT間,其轉(zhuǎn)換的頻率是顛換頻率的0.35倍,可見恩蚜小蜂屬的COI序列的變異率較高。經(jīng)分析堿基替換飽和性和P距離-R的關(guān)系,可以得出COI序列的系統(tǒng)發(fā)育信號也較好。
  4.恩蚜小蜂屬28S&COI數(shù)據(jù)集的序列保守位點為9,占總位點數(shù)的0.65%;序列變異位點為1346,占總變異位點的96.6%;簡約信息位點為1262,占序列總位點的90.5%;A+T的堿基含量為56.1%,C+G的堿基含量為43.

6、9%。其中轉(zhuǎn)換數(shù)為152,顛換數(shù)為327,轉(zhuǎn)換的頻率是顛換頻率的0.46倍,堿基的轉(zhuǎn)換主要發(fā)生在TC間。與28SrDNA序列的堿基替換情況相似,且恩蚜小蜂屬28S&COI數(shù)據(jù)集的保守性也較強。
  5.得出恩蚜小蜂屬4個確定的種團:aurantii種團(aurantii(lutea+(perniciosi+smithi)), strenua種團(sophia+(bimaculata+protransvena)),inaron種團(

7、inaron+(azimi)),luteola種團(luteola+meritoria)。
  6.與COI基因相比,恩蚜小蜂屬28SrDNA在28SrDNA&COI合并數(shù)據(jù)集中起主要作用,因此認(rèn)為28S基因更能夠提供有效的系統(tǒng)發(fā)育信息。
  7.運用特征法對DNA條形碼進行分析,且DNA條形碼在屬以下的鑒定水平上顯示出有效性。28SrDNA和COI基因序列均可對所研究的種類進行鑒定,且所有種類均在28SrDNA和COI基因

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