長江上游圓筒吻鮈遺傳結(jié)構(gòu)分析.pdf

1、圓筒吻鮈（Rhinogobio cylindricus）是長江中上游及其支流的特有魚類。近年來，隨著水電工程、環(huán)境污染、過度捕撈、外來物種入侵等多因素的干擾，使水生生物多樣性面臨巨大的挑戰(zhàn)。三峽大壩蓄水水位的不斷提高，向家壩水利工程的投入使用，都嚴重影響長江上游魚類的棲息地和生物量，圓筒吻鮈的群體數(shù)量也相應減少。為了對圓筒吻鮈的生物資源提供有效保護，必須對其遺傳結(jié)構(gòu)有充分的了解。本文采用兩種分子標記（線粒體DNA分子標記和微衛(wèi)星標記）探

2、討長江上游宜賓(YB)、萬州(WZ)、江滓(JJ)和合江(HJ)四個圓筒吻鮈群體的遺傳結(jié)構(gòu)。研究結(jié)果主要如下:
　　(1)分析了122尾圓筒吻鮈的線粒體Cytb序列，共檢測出22個單倍型，62個變異位點，圓筒吻鮈種群平均單倍型多樣性指數(shù)為0.716，平均核苷酸多樣性指數(shù)為0.01006，單倍型多樣性指數(shù)和核苷酸多樣性指數(shù)最高的均為宜賓群體。分析112尾圓筒吻鮈的控制區(qū)序列，共檢測出30個單倍型，60個變異位點，平均單倍型多樣性指數(shù)

3、為0.840，其中單倍型多樣性最高的為宜賓群體，平均核苷酸多樣性指數(shù)為0.01278，核苷酸多樣性指數(shù)最高的為萬州群體。合江(HJ)群體中，可能由于樣本數(shù)量較少，導致兩種線粒體分子標記中Hd指數(shù)與π指數(shù)都相對偏低。
　　(2)構(gòu)建的單倍型網(wǎng)絡結(jié)構(gòu)圖和單倍型系統(tǒng)發(fā)育樹均顯示圓筒吻鮈的單倍型分布與地理位置沒有明確的相關(guān)性。對Cyt b序列和控制區(qū)數(shù)據(jù)進行分子變異方差分析(AMOVA),結(jié)果表明群體間遺傳分化很小，變異主要存在于群體內(nèi)。

4、兩種分子標記的群體固定分化指數(shù)Fst均為負值，表明4個群體間呈低度分化。
　　(3)分別以Cyt b序列和控制區(qū)序列數(shù)據(jù)進行錯配分布分析、Tajima's D和Fu's Fs檢驗圓筒吻鮈4個種群的歷史變動，結(jié)果均顯示圓筒吻鮈未經(jīng)歷過種群擴張。
　　(4)利用9個微衛(wèi)星座位分別分析宜賓(YB)、萬州(WZ)、江津(JJ)和合江(HJ)四個群體，等位基因數(shù)介于6.8889(HJ)～14.0000(JJ)之間，平均值為10.333

5、3，基因豐富度較高;期望雜合度介于0.7518(HJ)～0.7845(WZ)之間，平均值為0.7704;觀測雜合度介于0.6880(JJ)～0.7879(HJ)，平均值為0.7373;多態(tài)信息含量值介于0.66784(HJ)～0.72903(WZ)，平均值為0.68095，屬高度多態(tài)。
　　(5)AMOVA分析結(jié)果表明，圓筒吻鮈的遺傳變異主要存在于種群內(nèi)部，只有少部分變異來源于種群間:遺傳分化指數(shù)Fst=0.03036（P=0.0