水稻抗白葉枯病種質(zhì)資源的發(fā)掘和抗病相關(guān)位點(diǎn)的鑒定.pdf

1、由Xanthomonas oryzae pv.Oryzae(Xoo)引起的白葉枯病是水稻生產(chǎn)中普遍發(fā)生、危害嚴(yán)重的一種細(xì)菌病害。本研究采用我國(guó)和菲律賓的4個(gè)Xoo代表菌株，人工接種評(píng)價(jià)了來(lái)源于32個(gè)國(guó)家和中國(guó)25個(gè)省份的701份基因組重測(cè)序水稻種質(zhì)資源的白葉枯病抗性，結(jié)合調(diào)查病斑長(zhǎng)度的表型數(shù)據(jù)和實(shí)驗(yàn)材料的SNPs數(shù)據(jù)進(jìn)行水稻白葉枯病抗性的全基因組關(guān)聯(lián)分析(Genome-WideAssociated Study，GWAS)，此外，通過(guò)構(gòu)建

2、遺傳分離群體，初步驗(yàn)證了一些抗病相關(guān)位點(diǎn)。主要研究結(jié)果如下:
　　1.抗病材料的篩選:分別采用Xoo代表菌株Zhe173(C3)、GD1358(C5)、PXO61(P1)和PXO339(P9a)對(duì)701份水稻種質(zhì)資源進(jìn)行人工接種，發(fā)現(xiàn)有29份水稻種質(zhì)資源對(duì)4個(gè)Xoo菌株具有較高抗性水平，篩選到對(duì)廣東強(qiáng)毒力菌株C5表現(xiàn)抗性的品種小紅谷和豪格勞。
　　2.將白葉枯病斑長(zhǎng)度的表型數(shù)據(jù)與水稻種質(zhì)資源的SNPs數(shù)據(jù)進(jìn)行全基因組關(guān)聯(lián)分析

3、，檢測(cè)到包含219個(gè)基因座的5432個(gè)顯著關(guān)聯(lián)位點(diǎn)。其中，已精細(xì)定位的4個(gè)抗性基因(Xa32，Xa35，Xa36和Xa40)和一個(gè)已克隆Xa4位于R34和R35內(nèi);R36和R40位置接近或直接位于兩個(gè)已克隆的抗性基因(xa25和Xa26)上，此外，在1，6，7，8和10號(hào)染色體上檢測(cè)到一些新的顯著關(guān)聯(lián)位點(diǎn)(Chr1_32274685，P=2.4×10-12; Chr6_5823342，P=1.4×10-13; Chr7_6376139，

4、P=4.0×10-11;Chr8_3317405, P=1.8×10-14; Chr10_1520158, P=1.7×10-14)。
　　3.抗性遺傳分析和定位群體構(gòu)建:利用抗白葉枯病水稻品種山酒谷、特青選恢為供體親本，與感病品種金剛30雜交，構(gòu)建F2分離群體。通過(guò)遺傳分析鑒定的位點(diǎn)與全基因組關(guān)聯(lián)分析定位的位點(diǎn)大部分重合或接近。
　　4.基于GWAS結(jié)果，針對(duì)C5和Ⅳ菌株顯著關(guān)聯(lián)SNPs中的非同義突變SNPs位點(diǎn)開(kāi)發(fā)了2個(gè)