生物醫(yī)學本體匹配與集成技術的研究.pdf

1、起源于哲學的本體作為一種能在語義和知識層次上描述概念的建模工具，可有效地解決知識工程中知識共享和重用兩大問題。近幾年來，隨著生命科學的快速發(fā)展，生物醫(yī)學領域也出現(xiàn)了大量的本體并且很多本體之間都存在著信息交疊的現(xiàn)象。但是這些本體大多是由不同組織、機構和研究者開發(fā)的。因此，在本體表示和本體構建上存在異構問題。為了能夠充分利用已有的本體資源，有效地進行資源整合，構建面向特定需求的本體庫，本文提出了基于任務的本體集成方法。
　　本體集成的

2、核心問題是概念和關系的相似度度量，其中概念相似度度量包括兩個方面：
　?。?）語義相似度度量。
　?。?）語用相似度度量。
　　關系的相似度度量是通過對與關系相關的概念相似度度量來實現(xiàn)的。生物醫(yī)學本體的概念通常是由詞組甚至是包含數(shù)字的詞組等更復雜的形式構成，因此給概念的相似性度量造成了很大的困難。為了更準確的度量生物醫(yī)學概念的相似性，本文首先對本體概念進行預處理，將其分解成為多個token串并對每個token進行詞性標

3、注，然后使用基于WordNet和編輯距離的兩種相似度算法對兩個概念的token對進行相似度度量，最后將概念間的token對的相似度進行加權平均的到兩個概念的相似度，取得了較好的語義層面的概念相似度。另一方面，利用本體的層次結構和概念的屬性并借助領域本體UMLS進行概念語用相似度的度量，從而獲得了較好的語用層面的概念相似度。
　　為了利用現(xiàn)有本體構建面向特定需求的本體庫，本文引入了核心本體的概念，并通過核心本體的集成完成了對本體間交