14232.用支持向量機(jī)和離散增量方法預(yù)測人類血液分泌蛋白質(zhì)

1、分類號(hào)——UDC論文題目1012631046017密級(jí)——編號(hào)——研究生：紅墓指導(dǎo)教師：隆羝亙副熬援專業(yè)：塹堡堂研究方向：堡途生塑塑堡堂學(xué)院：塹堡型堂皇撞苤堂瞳2013年5月12日內(nèi)蒙古大學(xué)碩士學(xué)位論文用支持向量機(jī)和離散增量方法預(yù)測人類血液分泌蛋白質(zhì)用支持向量機(jī)和離散增量方法預(yù)測人類血液分泌蛋白質(zhì)摘要分泌蛋白質(zhì)(secretoryprotein)是合成在細(xì)胞內(nèi)的蛋白質(zhì)，通過各種分泌途徑分泌到細(xì)胞外，在生物體中，蛋白質(zhì)的分泌發(fā)生是一種普遍

2、的生物過程，蛋白質(zhì)的分泌是生物體保證基本生命活動(dòng)的重要方式。分泌蛋白質(zhì)中的一類一一人類血液分泌蛋白質(zhì)是與癌癥、腫瘤等人類重大疾病相關(guān)的，可以用它們來判斷癌癥類型及疾病惡化階段，并用于新藥物的開發(fā)。因此，在生物信息學(xué)研究領(lǐng)域，采用有效的方法來確定和預(yù)測人類血液分泌蛋白質(zhì)是至關(guān)重要的。由于人類血液中蛋白質(zhì)組成的復(fù)雜性和蛋白質(zhì)運(yùn)動(dòng)范圍的廣泛性，識(shí)別人類血液分泌蛋白質(zhì)非常具有挑戰(zhàn)性。本論文以人類血液分泌蛋白質(zhì)作為研究對(duì)象，采用不同的預(yù)測方法，分

3、別對(duì)人類血液分泌蛋白質(zhì)進(jìn)行了預(yù)測研究。論文的主要研究工作如下：1隨著蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫的不斷更新，構(gòu)建了新的人類血液分泌蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)集，擴(kuò)大了人類血液分泌蛋白質(zhì)的序列條數(shù)。2利用支持向量機(jī)(SVM)、離散增量(ID)和離散增量結(jié)合支持向量機(jī)(IDSVM)方法，分別對(duì)人類血液分泌蛋白質(zhì)進(jìn)行預(yù)測，均取得了較好的預(yù)測效果。3提取了一種新的蛋白質(zhì)序列特征信息一一平均化學(xué)位移信息，并與其它蛋白質(zhì)序列信息組合，分別作為SVM、ID和IDSVM算法的特征向量