版權(quán)說明:本文檔由用戶提供并上傳,收益歸屬內(nèi)容提供方,若內(nèi)容存在侵權(quán),請進行舉報或認領(lǐng)
文檔簡介
1、本論文針對日前多營養(yǎng)層次養(yǎng)殖池塘微生物作用研究的熱點問題,將微生物分子生態(tài)學PCR-DGGE技術(shù)引入到我國北方海水多營養(yǎng)層次養(yǎng)殖池塘微生物生態(tài)學的研究中,優(yōu)化了提取養(yǎng)殖池塘底泥基因組DNA及變性梯度凝膠電泳的條件,同時運用平板計數(shù)法對三個不同養(yǎng)殖模式的對蝦養(yǎng)殖池塘沉積物的細菌數(shù)量及細菌群落多樣性隨養(yǎng)殖周期的動態(tài)變化進行了研究,分析了細菌多樣性在時間和空間上的變化規(guī)律,為養(yǎng)殖區(qū)生態(tài)平衡的維持提供依據(jù)。同時對池塘沉積物DGGE圖譜的顯著條帶
2、進行克隆測序,獲得養(yǎng)殖池塘優(yōu)勢微生物的基因信息,為從原生環(huán)境分離篩選有益功能微生物奠定了基礎(chǔ)。運用統(tǒng)計學方法,將海水多營養(yǎng)層次養(yǎng)殖池塘沉積物細菌數(shù)量和菌群結(jié)構(gòu)與環(huán)境因子的相互作用關(guān)系進行了初步探討,為預測養(yǎng)殖環(huán)境微生物結(jié)構(gòu)的變化提供參考。主要研究結(jié)果如下:
1.PCR-DGGE檢測條件的優(yōu)化
從環(huán)境樣品DNA提取方法和PCR擴增條件等方面,探討了DGGE圖譜的優(yōu)化條件,優(yōu)化結(jié)果如下:確定了CTAB的提取DNA方法,可
3、以得到高產(chǎn)率、完整清晰的主帶。以此DNA為模板,引物GC-F341/R534的降落PCR反應條件進行擴增。變性梯度凝膠電泳最優(yōu)變性劑濃度梯度范圍為45%-55%,電壓為60v,電泳時間10h,采用銀染染色方法,優(yōu)化后的條件能得到最佳分辨率的DGGE圖譜,條帶分辨清晰。
2.多營養(yǎng)層次養(yǎng)殖池塘沉積物細菌群落的結(jié)構(gòu)變化
通過對不同養(yǎng)殖模式池塘底泥的DGGE分析,運用凝膠分析軟件分析了DGGE電泳圖譜,結(jié)果如下:
4、?。?)三個養(yǎng)殖池塘共計27個樣品中,樣品條帶數(shù)豐富,總共發(fā)現(xiàn)46條不同位置的DGGE條帶。每個樣品的條帶數(shù)在14-33條之間,條帶的含量在不同養(yǎng)殖時期有大幅度的變化,條帶的分布模式也有較大差異。比較三個池塘的樣品,結(jié)果顯示不同樣品條帶數(shù)穩(wěn)定,平均45%為特異性條帶,55%的條帶在各樣品中普遍存在。這說明不同養(yǎng)殖模式池塘的底泥中含有一部分相同的菌群結(jié)構(gòu),也存在各自的特異性菌群,海水多營養(yǎng)層次養(yǎng)殖池塘中細菌種類繁多,隨養(yǎng)殖時間的推移菌群含
5、量和結(jié)構(gòu)上都有很大變化,不同樣品間存在差異。
?。?)對各養(yǎng)殖時期的DGGE圖譜做了聚類分析,UPGMA分析圖反映了微生物群落結(jié)構(gòu)隨養(yǎng)殖周期發(fā)生規(guī)律性變化。通過計算Shannon-Wiener多樣性指數(shù)反映不同樣品的菌群多樣性隨時空變化的規(guī)律。本研究中所得的Shannon-Wiener指數(shù)處于較高水平,這說明多營養(yǎng)層次養(yǎng)殖池塘沉積物樣品多樣性非常高。從空間上看相比較其它兩個養(yǎng)殖池塘蝦蟹貝混養(yǎng)的Shannon-Wiener指數(shù)較高
6、且變化幅度不大,說明蝦蟹貝混養(yǎng)模式的微生物群落多樣性高且群落穩(wěn)定性高。從時間上看,在養(yǎng)殖中期各養(yǎng)殖池塘的微生物群落多樣性最高。
(3)通過結(jié)合測序結(jié)果及系統(tǒng)發(fā)育分析表明,海水多營養(yǎng)層次池塘沉積物所得的細菌主要分為8個類群,包括厚壁菌門、變性菌門(有α-變形菌綱、β-變形菌綱、γ-變形菌綱、ε-變形菌綱和δ-變形菌綱)、擬桿菌門、放線菌門、綠彎菌門、藍細菌、綠菌門、酸桿菌門。以上微生物種群大部分是在空間和時間上分布均勻的群落,也
7、有不同營養(yǎng)層次養(yǎng)殖池塘獨有的細菌種群:放線菌門、綠彎菌門是蝦蟹貝養(yǎng)殖池塘的獨有優(yōu)勢種群,均在養(yǎng)殖中期出現(xiàn)并占據(jù)優(yōu)勢;厚壁菌門是蝦蟹養(yǎng)殖池塘的獨有菌群,但僅在養(yǎng)殖中期出現(xiàn),綠菌門僅在蝦蟹養(yǎng)殖后期出現(xiàn)過;酸桿菌門是對蝦單養(yǎng)池塘的獨有菌群,在養(yǎng)殖前期出現(xiàn)后逐漸衰退消失。藍細菌在蝦蟹和蝦蟹貝養(yǎng)殖池塘后期均有發(fā)現(xiàn)。
3.養(yǎng)殖池塘細菌變動與理化因子相關(guān)性分析
通過對養(yǎng)殖周期內(nèi)理化指標和細菌數(shù)量的動態(tài)監(jiān)測,結(jié)果表明養(yǎng)殖過程中各理化
8、因子變化范圍均在養(yǎng)殖對蝦的耐受范圍之內(nèi)。不同養(yǎng)殖池塘底泥中異養(yǎng)菌總數(shù)和弧菌總數(shù)隨養(yǎng)殖時間的增加而發(fā)生變化,其中弧菌數(shù)量的波動較異養(yǎng)菌總數(shù)要大,這可能是由于底泥中弧菌數(shù)量對理化因子的波動更為敏感。相關(guān)性分析表明,養(yǎng)殖池塘的底泥細菌總數(shù)與有機質(zhì)的含量呈正相關(guān),水體氮營養(yǎng)鹽含量、溫度均影響底泥細菌數(shù)量的變動,而弧菌的數(shù)量與各理化指標的變動無顯著性關(guān)聯(lián)。對微生物群落的變動與養(yǎng)殖環(huán)境理化因子做了典型性對應分析,由結(jié)果可知本研究中檢測的理化包涵了與
溫馨提示
- 1. 本站所有資源如無特殊說明,都需要本地電腦安裝OFFICE2007和PDF閱讀器。圖紙軟件為CAD,CAXA,PROE,UG,SolidWorks等.壓縮文件請下載最新的WinRAR軟件解壓。
- 2. 本站的文檔不包含任何第三方提供的附件圖紙等,如果需要附件,請聯(lián)系上傳者。文件的所有權(quán)益歸上傳用戶所有。
- 3. 本站RAR壓縮包中若帶圖紙,網(wǎng)頁內(nèi)容里面會有圖紙預覽,若沒有圖紙預覽就沒有圖紙。
- 4. 未經(jīng)權(quán)益所有人同意不得將文件中的內(nèi)容挪作商業(yè)或盈利用途。
- 5. 眾賞文庫僅提供信息存儲空間,僅對用戶上傳內(nèi)容的表現(xiàn)方式做保護處理,對用戶上傳分享的文檔內(nèi)容本身不做任何修改或編輯,并不能對任何下載內(nèi)容負責。
- 6. 下載文件中如有侵權(quán)或不適當內(nèi)容,請與我們聯(lián)系,我們立即糾正。
- 7. 本站不保證下載資源的準確性、安全性和完整性, 同時也不承擔用戶因使用這些下載資源對自己和他人造成任何形式的傷害或損失。
最新文檔
- 草魚養(yǎng)殖池塘內(nèi)細菌群落及益生菌對水質(zhì)和細菌群落的影響.pdf
- 南美白對蝦生態(tài)綜合養(yǎng)殖池塘底泥細菌群落結(jié)構(gòu)及功能多樣性研究.pdf
- 池蝶蚌養(yǎng)殖池塘季節(jié)性浮游植物群落與環(huán)境因子的CCA分析.pdf
- 海蜇養(yǎng)殖對養(yǎng)殖池塘環(huán)境影響的研究.pdf
- 不同養(yǎng)殖密度下蝦貝綜合養(yǎng)殖池塘幾種生態(tài)因子的影響分析.pdf
- 生態(tài)循環(huán)水養(yǎng)殖池塘微生物群落結(jié)構(gòu)特征初步分析.pdf
- 刺參養(yǎng)殖池塘重金屬分布規(guī)律及生態(tài)風險分析.pdf
- 湛江養(yǎng)殖海區(qū)細菌數(shù)與水質(zhì)因子相關(guān)性及弧菌種群結(jié)構(gòu)的分析.pdf
- 錦州凡納濱對蝦高位養(yǎng)殖池塘生態(tài)特征研究.pdf
- 養(yǎng)殖池塘底質(zhì)營養(yǎng)物質(zhì)歸趨特征及改良技術(shù)的研究.pdf
- 沉水植物在養(yǎng)殖池塘中的生態(tài)效應
- 草魚養(yǎng)殖池塘溶氧收支平衡及關(guān)鍵影響因子的研究.pdf
- 富營養(yǎng)化湖泊環(huán)境影響因子相關(guān)性分析研究.pdf
- 與海水養(yǎng)殖相關(guān)的細菌多樣性的研究及方法評價.pdf
- 綜合海水養(yǎng)殖池塘主要營養(yǎng)要素及重金屬污染物的食物網(wǎng)傳遞過程的初步研究.pdf
- 刺參養(yǎng)殖池塘混養(yǎng)新品種的相關(guān)基礎(chǔ)研究.pdf
- 淡水養(yǎng)殖池塘環(huán)境中氨氧化微生物的研究.pdf
- 循環(huán)水養(yǎng)殖池塘浮游生物群落結(jié)構(gòu)變化規(guī)律的研究.pdf
- 刺參養(yǎng)殖池塘沉積物—水界面營養(yǎng)鹽通量的研究.pdf
- 羅非魚養(yǎng)殖池塘的理化特征與微生物群落構(gòu)建的響應.pdf
評論
0/150
提交評論