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文檔簡介
1、氨氧化古菌(AOA)能夠在一些氧含量極低的環(huán)境條件下進行氨氧化作用,并且 AOA amoA基因在環(huán)境宏基因組中有著遠遠高于 AOB amoA基因的考貝數(shù),這引起了越來越多的關(guān)注。本課題應(yīng)用分子生學(xué)物手段,結(jié)合生物信息分析軟件,研究了東北平原地區(qū)冬季不同土壤環(huán)境下,氨氧化古菌和氨氧化細菌的 amoA基因的多樣性、群落結(jié)構(gòu)、及系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系,比較了不同的環(huán)境因子影響下氨氧化微生物的豐富程度和分布規(guī)律,探索了影響 AOA分布的生態(tài)因子條件,為探
2、明氨氧化古菌的生理機制提供了實驗證據(jù),同時對印證氨氧化古菌在全球氮循環(huán)中的地位提供了進一步的理論支持。
本課題應(yīng)用分子生物學(xué)技術(shù)從濕地、旱土、河流沉積物樣品中提取微生物全基因組,分別應(yīng)用針對 AOA和 AOB amoA基因特異性引物擴增目的基因,進而構(gòu)建克隆文庫。測序結(jié)果應(yīng)用生物信息學(xué)軟件 Mothur和 MEGA進行 OTU分類分析,計算不同環(huán)境樣品內(nèi)部克隆子之間和各分組間的物種豐度、分布差異、生物多樣性差別,構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)生樹
3、。將統(tǒng)計結(jié)果與環(huán)境因子結(jié)合進行分析。
研究結(jié)果表明,AOA在平原陸生環(huán)境中廣泛存在,對生態(tài)因子的改變具有良好的適應(yīng)性。在本研究中,濕地環(huán)境和旱地環(huán)境中的 AOA各有其不同的優(yōu)勢物種。由于一些在濕地環(huán)境中廣泛存在的 AOA在旱地土壤中也有分布,這些濕地環(huán)境中的 AOA對環(huán)境因子的耐受性顯然更強。在以后的研究中應(yīng)針對應(yīng)用目的的不同,采集不同的環(huán)境樣品作為研究對象。不同生境中,AOA的多樣性截然不同,不同環(huán)境的 AOA,在系統(tǒng)發(fā)生分
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