中國馬業(yè)綜合數(shù)據(jù)庫的建立及馬基因組序列預(yù)測.pdf

1、現(xiàn)代生物學(xué)的發(fā)展促進了生物信息學(xué)的產(chǎn)生。生物信息學(xué)是將信息學(xué)的理論技術(shù)應(yīng)用于生物數(shù)據(jù)的管理和分析，是數(shù)學(xué)、物理學(xué)、計算機科學(xué)、化學(xué)、生命科學(xué)等多學(xué)科的交叉學(xué)科。生物信息學(xué)研究的范圍十分廣泛，其中數(shù)據(jù)庫的構(gòu)建就是一個重要方面。如何用理論和計算的方法識別和預(yù)測內(nèi)含子和外顯子也是目前生物信息學(xué)研究工作的重要任務(wù)。本課題通過自編程序建立了以中國馬品種資源為主的中國馬業(yè)綜合數(shù)據(jù)庫www.chinahorse．org．cn。并在建立數(shù)據(jù)庫的基礎(chǔ)上，

2、初步實現(xiàn)了數(shù)據(jù)庫應(yīng)用，包括基于Web的文獻數(shù)據(jù)庫的網(wǎng)絡(luò)化查詢等。它將為建立馬品種資源的科學(xué)研究平臺打下基礎(chǔ)。 本研究的主要內(nèi)容及結(jié)果如下： 1.建立了專一化、系統(tǒng)化、完整化的馬業(yè)科學(xué)數(shù)據(jù)庫。序列數(shù)據(jù)庫中以基因數(shù)據(jù)庫和蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫為主，非序列數(shù)據(jù)庫以文獻數(shù)據(jù)庫和圖片數(shù)據(jù)庫為主。其中，馬的基因數(shù)據(jù)庫中的記錄量超過了2萬，馬的蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫的記錄超過3萬。 2.建立了中國馬物種資源數(shù)據(jù)庫。涉及品種的外貌、類型、典型特征等多個性狀，為從事

3、中國物種品種遺傳資源的利用與保護提供了參考。 3.建立了馬生物信息學(xué)研究平臺?？梢詫蚝偷鞍踪|(zhì)進行相關(guān)生物信息學(xué)研究，對于進行科研和教學(xué)具有一定價值。 4.建立了馬業(yè)科學(xué)實驗室網(wǎng)站與馬業(yè)論壇?？梢酝ㄟ^互聯(lián)網(wǎng)進行數(shù)據(jù)庫的檢索，提高了數(shù)據(jù)庫的應(yīng)用效率。網(wǎng)站的建設(shè)還可以為數(shù)據(jù)庫的更新帶來方便，也為本研究領(lǐng)域內(nèi)的交流與合作起到橋梁作用。本研究還通過對已發(fā)表的馬全基因組序列的密碼子使用頻率做了初步的統(tǒng)計分析工作并對內(nèi)含子和外顯子進行了預(yù)測?；?/p>