人類基因組結構注釋數據庫構建及數據可視化展示.pdf

1、國際人類基因組計劃首席科學家Collins明確指出基因組研究的下一個階段是注釋出基因組中的各功能元件。其中，了解基因DNA中的蛋白質編碼基因及其內部結構，是了解基因組功能的首要核心問題。為此，對人類基因組蛋白質編碼基因及其結構進行收集、整合和預測，建立人類基因組數據庫系統(tǒng)，面向全世界公開發(fā)布注釋的人類基因組結構注釋數據成為目前各大生物信息著名研究機構的研制重點。
　　 對于人類基因組蛋白質編碼基因及其結構數據的收集和獲取而言，構

2、建可靠數據集和提供相應的預測注釋數據是該工作不可或缺的兩部分。其中構建來源于實驗方法的可靠數據集不僅可提供準確無誤并具有相應支持證據的可靠數據，同時還可滿足基因結構預測相關研究對數據集的需求；另一方面，基于生物信息學方面預測得到的基因組蛋白質編碼基因及其結構數據將成為可靠數據的有益補充，適應基因組數據的迅速增長。
　　 建立了人類基因組結構注釋數據庫系統(tǒng)，存儲和管理人類基因組蛋白質編碼基因及其結構數據。通過理解人類基因組結構注釋

3、數據內容以及數據關系，詳細的分析人類基因組注釋系統(tǒng)關鍵的事務處理流程，利用關系型數據庫設計方法設計了數據的存儲模型，并根據數據對象的特點與應用的特殊性，采用了冗余備份的思想優(yōu)化數據庫的訪問效率，并根據不同的數據變化方式，提出了相應的數據庫擴展方法。
　　 對人類基因組蛋白質編碼基因及其結構數據進行了web發(fā)布，實現了基因組結構注釋數據的web瀏覽訪問。采用了分層策略與“軌道”的顯示方式可視化展示注釋數據，并采用了SVG圖形技術克