生菜葉裂與莖刺性狀的遺傳定位.pdf

1、生菜在世界上廣泛種植，是一種重要的葉用蔬菜。在生產(chǎn)上具有十分重要的價值。生菜在進化過程中出現(xiàn)了各式各樣的類型，因此具有豐富的葉型，為研究生菜葉裂提供了豐富的材料。野生種生菜莖富集有較多的刺，而在栽培種中這種性狀卻丟失了，這為研究生菜的進化提供了很好的材料。目前生菜葉型的多樣性及莖刺的丟失分子機制尚未明確。在本研究中，主要通過構(gòu)建不同F(xiàn)2代分離群體克隆控制莖刺和葉裂的目的基因。研究結(jié)果如下:
　　1.關(guān)于葉裂性狀的研究:
　　

2、選擇兩組不同的葉型親本PI491070（葉完整）、PI536760(葉裂)和散葉PI536720（葉半裂）、W46（葉完整）進行雜交得到F1代，F(xiàn)1代自交得到F2代;從F2分離群體中各選取30株葉裂和葉完整的植株構(gòu)建兩個極端池，對兩個極端池提取RNA并測序，將測序得到的RNA-seq數(shù)據(jù)回帖到生菜基因組，計算等位基因SNP位點在兩個池中的頻率。根據(jù)此原理，通過分析等位基因SNP頻率差異在不同染色體上的分布，發(fā)現(xiàn)控制兩種不同的葉裂方式的基

3、因定位在同一區(qū)域:3號染色體的90Mb到140Mb之間。利用4000株P(guān)I491070（葉完整）×PI536760(葉裂)F2大群體最終將目的基因定位在116.24Mb到118.15Mb之間。對該區(qū)段內(nèi)進行候選基因的預(yù)測與分析，發(fā)現(xiàn)在該區(qū)域內(nèi)存在24個基因，其中基因LG3316063主要參與鋅指蛋白的構(gòu)成，該基因在兩親本中有1個堿基的差異導(dǎo)致了氨基酸的改變。隨機挑選12個不同葉裂與葉完整的品種，該基因的基因型與表型變化一致。推測該基因可

4、能是控制葉裂形成的候選基因。
　　2.關(guān)于莖刺性狀的研究:
　　本研究發(fā)現(xiàn)生菜莖刺是由多細(xì)胞組成。采用同樣的BSR-seq分析方對莖刺性狀進行遺傳分析。選擇491245(有刺)和W111（無刺）兩親本，構(gòu)建F2分離群體，從F2群體中各選取30株有刺（顯性）和無刺（隱性）的植株構(gòu)建兩個極端池，對兩個極端池提取RNA并測序，將目的基因初步定位在Chr5:304.36Mb-311.96Mb區(qū)域，利用3500株F2代大群體進行精細(xì)定