醫(yī)學(xué)信息獲取與管理之2011

1、南方醫(yī)科大學(xué)醫(yī)學(xué)情報(bào)學(xué)教研室 張政寶Tel: 020-61648054 E-mail: newinfoman@163.com,醫(yī)學(xué)信息獲取與管理緒論,緒論,課程簡(jiǎn)介信息、知識(shí)、情報(bào)、文獻(xiàn)的基本概念文獻(xiàn)的類型檢索的概念檢索語(yǔ)言及其應(yīng)用檢索策略與檢索技術(shù),課程簡(jiǎn)介,內(nèi)容體系課程安排上網(wǎng)賬號(hào)精品課程網(wǎng)站：http://jpkc.fimmu.com/yxxx/,觀察兩張照片有什么區(qū)別？,蘇聯(lián)最早一批宇航員合影,后排站著

2、的格里戈里耶·奈爾尤伯夫(上圖)后來(lái)被人從照片上抹去(右圖)。,失蹤的宇航員,,馬家窯。人抬、肩扛。 1959國(guó)慶觀禮臺(tái),信息分析無(wú)處不在,日本從新聞聯(lián)播和電視劇著手研究中國(guó)外國(guó)借用互聯(lián)網(wǎng)圖片搜索引擎捕捉中國(guó)情報(bào)中國(guó)電視劇也成日本民間智囊研究課題地質(zhì)專家憑錄像巖石判斷：拉登藏身阿西南深谷,信息素養(yǎng)：信息檢索其實(shí)離我們很近,廣州某公司在報(bào)紙上刊登了一則招聘營(yíng)銷人員的招聘啟事，應(yīng)聘條件、工資待遇等內(nèi)容一應(yīng)俱全，參加筆試、面

3、試等要求也非常明確，可通篇啟事從頭看到尾，就是沒有發(fā)現(xiàn)應(yīng)聘的聯(lián)系方法。 多數(shù)人認(rèn)為這是招聘單位疏忽或是報(bào)社排版錯(cuò)誤，于是，便耐心等著報(bào)社刊登更正或補(bǔ)充說(shuō)明。 有3位應(yīng)聘者見招聘的崗位適合自己，不是等待：小王通過(guò)因特網(wǎng)搜索小張立即通過(guò)114查號(hào)臺(tái)查詢 小劉依稀記得該公司在某商業(yè)區(qū)有一個(gè)廣告牌，于是騎車圍著城區(qū)轉(zhuǎn)了一下午，終于找到了廣告牌,信息、知識(shí)、情報(bào)、文獻(xiàn)的基本概念,信息：信息是物質(zhì)存在的一種方式、形態(tài)或運(yùn)動(dòng)狀態(tài)，是事物的一

4、種普遍屬性，一般指數(shù)據(jù)、消息中包含的意義，可以使消息中所描述事件的不定性減少。知識(shí)：人們?cè)诟脑焓澜绲膶?shí)踐中所獲得的認(rèn)識(shí)和經(jīng)驗(yàn)的總和，是人的大腦通過(guò)思維重新組合的系統(tǒng)化的信息集合。情報(bào)：為解決一個(gè)特定的問題所需要的激活了的、活化了的特殊知識(shí)或信息。情報(bào)的基本屬性：知識(shí)性、傳遞性、效用性,信息、知識(shí)、情報(bào)、文獻(xiàn)的基本概念,文獻(xiàn)：記錄有知識(shí)的一切載體。 （GB3792.1-83《文獻(xiàn)著錄總則》）文獻(xiàn)的三個(gè)基本要素：①記錄知識(shí)的具

5、體內(nèi)容；②記錄知識(shí)的手段，如文字、圖形、符號(hào)、聲頻、視頻等；③記錄知識(shí)的物質(zhì)載體，如紙張、光盤、錄像帶等；信息、知識(shí)、情報(bào)與文獻(xiàn)的關(guān)系,文獻(xiàn)的類型,目,一、文獻(xiàn)的類型（按載體類型分）:印刷型：傳統(tǒng)的圖書、期刊等視聽型：唱片、錄音帶、錄像帶等縮微型：縮微膠卷、縮微膠片等數(shù)字型（或電子型）：電子圖書、電子期刊、數(shù)據(jù)庫(kù)等,文獻(xiàn)的類型,二、文獻(xiàn)的級(jí)別（按文獻(xiàn)加工深度分）一次文獻(xiàn)：即原始文獻(xiàn)，指著者以其本人的研究成果（如實(shí)驗(yàn)、觀察

6、、調(diào)查研究等的結(jié)果）為基本素材寫成的原始創(chuàng)作。例如：專著、期刊論文、研究報(bào)告、會(huì)議文獻(xiàn)、專利文獻(xiàn)、學(xué)位論文、會(huì)議論文、譯文、電子期刊、電子圖書等。,文獻(xiàn)的類型,二、文獻(xiàn)的級(jí)別（按文獻(xiàn)加工深度分）二次文獻(xiàn)：將大量無(wú)序、分散的一次文獻(xiàn)收集、整理、加工、著錄，并按一定的順序加以編排，形成可供檢索一次文獻(xiàn)線索的新的文獻(xiàn)形式。因其檢索功能而稱之為檢索工具或檢索系統(tǒng)。例如：題錄、目錄、索引、文摘等。題錄：以期刊論文為例，加下劃線部分為文獻(xiàn)出

7、處。 題名/著者//期刊名.年,卷(期).–頁(yè)碼,文獻(xiàn)的類型,二、文獻(xiàn)的級(jí)別（按文獻(xiàn)加工深度分）三次文獻(xiàn)：圍繞某一專題，利用二次文獻(xiàn)的檢索，在吸取一次文獻(xiàn)內(nèi)容的基礎(chǔ)上形成的文獻(xiàn)。如綜述、述評(píng)、進(jìn)展等期刊文獻(xiàn)和百科全書、年鑒、指南、手冊(cè)等參考工具書。綜述（Survey, Review）是指綜合分析和描述一定時(shí)間范圍內(nèi)某一學(xué)科或?qū)I(yè)科研發(fā)展和現(xiàn)狀，并預(yù)測(cè)未來(lái)的一類文獻(xiàn)。,文獻(xiàn)的類型,二、文獻(xiàn)的級(jí)別（按文獻(xiàn)加工深度分）*零次文

8、獻(xiàn)：未經(jīng)信息加工，直接記錄在載體上的原始信息，如實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)、試驗(yàn)記錄、調(diào)查材料、設(shè)計(jì)草圖、私人筆記、口頭交流的信息等。,檢索的概念,檢索（Retrieval）：利用檢索工具查詢問題答案的全過(guò)程。文獻(xiàn)檢索（Literature retrieval）：指以獲取文獻(xiàn)為目的，科學(xué)地借助各種檢索工具，查詢相關(guān)文獻(xiàn)資料的過(guò)程。信息檢索（Information retrieval）：指從任何信息集合中查出所需信息的活動(dòng)、過(guò)程和方法，有廣義和狹義兩種

9、理解。廣義的信息檢索還包括信息存儲(chǔ)，合稱信息存儲(chǔ)與檢索。狹義的信息檢索僅指信息的查找過(guò)程。,檢索語(yǔ)言及其應(yīng)用,檢索語(yǔ)言是信息存儲(chǔ)與檢索過(guò)程中描述信息特征和表達(dá)用戶信息提問的一種人工語(yǔ)言。它是根據(jù)文獻(xiàn)的外表特征或者內(nèi)容特征，把某些具有檢索意義的語(yǔ)言或符號(hào)加工編制成為文獻(xiàn)信息檢索服務(wù)的特殊語(yǔ)言。檢索語(yǔ)言的主要作用是對(duì)文獻(xiàn)的外表特征和內(nèi)容特征進(jìn)行多層次描述，提供多種檢索途徑，以方便用戶從不同角度進(jìn)行檢索查找。,檢索語(yǔ)言的結(jié)構(gòu),檢索語(yǔ)言,,

10、描述文獻(xiàn)外表特征,描述文獻(xiàn)內(nèi)容特征,,書刊篇名—題名索引（途徑）著者姓名—著者索引（途徑）文獻(xiàn)序號(hào)—序號(hào)索引（途徑）引用文獻(xiàn)—引文索引（途徑）,,體系分類語(yǔ)言—分類索引（途徑）主題語(yǔ)言（單元詞、關(guān)鍵詞、敘詞等）代碼語(yǔ)言（分子式、結(jié)構(gòu)式等）,分類語(yǔ)言,中國(guó)圖書館圖書分類法（中圖法）國(guó)際十進(jìn)分類法（Universal Decimal Classification, UDC）美國(guó)國(guó)會(huì)圖書館圖書分類法（Library of Con

11、gress Classification, LC）,中圖法基本大類,A 馬克思主義、列寧主義、毛澤東思想 B 哲學(xué) C 社會(huì)科學(xué)總論 D 政治、法律 E 軍事 F 經(jīng) 濟(jì) G 文化、科學(xué)、教育、體育 H 語(yǔ)言、文學(xué) I 文學(xué) J 藝術(shù) K 歷史、地理,N 自然科學(xué)總論O 數(shù)理科學(xué)和化學(xué)P 天文學(xué)、

12、地球科學(xué)Q 生物科學(xué)R 醫(yī)藥、衛(wèi)生S 農(nóng)業(yè)科學(xué)T 工業(yè)技術(shù)U 交通運(yùn)輸V 航空、航天X 環(huán)境科學(xué)、勞動(dòng)保護(hù)科學(xué)（安全科學(xué)）Z 綜合性圖書,R 醫(yī)藥衛(wèi)生,R1 預(yù)防醫(yī)學(xué)、衛(wèi)生學(xué)R2 中國(guó)醫(yī)學(xué)R3 基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)R4 臨床醫(yī)學(xué)R5 內(nèi)科學(xué)R6 外科學(xué)R71 婦產(chǎn)科學(xué)R72 兒科學(xué)R73 腫瘤學(xué)R74 神經(jīng)病學(xué)與精神病學(xué)R75 皮膚病學(xué)

13、與性病學(xué)R76 耳鼻咽喉科學(xué) R77 眼科學(xué)R8 特種醫(yī)學(xué)R9 藥學(xué),,主題語(yǔ)言,關(guān)鍵詞：指出現(xiàn)在文獻(xiàn)的標(biāo)題、文摘或全文中，能表達(dá)文獻(xiàn)實(shí)質(zhì)內(nèi)容的，或者能被人們作為檢索入口的關(guān)鍵性專業(yè)名詞術(shù)語(yǔ)。是一種沒有規(guī)范化的自然語(yǔ)言，又稱為自由詞。主題詞：是一種反映文獻(xiàn)內(nèi)容主題、經(jīng)過(guò)嚴(yán)格規(guī)范化了的人工語(yǔ)言。即是將反映文獻(xiàn)主題的各種同義詞進(jìn)行書寫形式的統(tǒng)一化后定下的檢索語(yǔ)言。,例：肺癌的手術(shù)治療,肺癌 肺鱗狀細(xì)胞癌

14、肺母細(xì)胞瘤 肺類癌肺腺癌 肺腫瘤外科學(xué),主題詞,,關(guān)鍵詞（自由詞）,副主題詞,,《醫(yī)學(xué)主題詞表》（MeSH詞表）《漢語(yǔ)主題詞表》《中醫(yī)藥學(xué)主題詞表》,主題語(yǔ)言,檢索策略與檢索技術(shù),,檢索策略：  1.課題分析，明確檢索目的； 2.根據(jù)檢索要求，選擇檢索工具； 3.確定檢索途徑，制訂檢索策略； 4.評(píng)價(jià)檢索效果； 5.調(diào)整檢索策略； 6.根據(jù)文獻(xiàn)出處，獲取原始文獻(xiàn)。,科研課題常見信息需求,查找某概

15、念的確切含義：如“什么是端粒酶” 查找某概念的背景知識(shí) 如：“誰(shuí)最先發(fā)現(xiàn)了傳染性蛋白”查找某些事物的數(shù)值及量化指標(biāo): 如“2003-2004我國(guó)肺癌的發(fā)病率” 如“阿司匹林的中毒劑量”查找某一類學(xué)科一般知識(shí)： 如“有關(guān)醫(yī)院管理有哪些專著”查找學(xué)科專業(yè)領(lǐng)域的新進(jìn)展: “有關(guān)醫(yī)院管理發(fā)展趨勢(shì)研究的綜述文獻(xiàn)”查找專業(yè)課題相關(guān)的研究文獻(xiàn)；

16、 “有關(guān)醫(yī)院信息系統(tǒng)建構(gòu)”的研究文獻(xiàn),,,特征型知識(shí)（事實(shí)、數(shù)值類數(shù)據(jù)庫(kù)、搜索引擎）,,,關(guān)聯(lián)型知識(shí)（文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫(kù)）,檢索效果的評(píng)價(jià),檢出的相關(guān)文獻(xiàn)量 檢出的文獻(xiàn)總量,檢出的相關(guān)文獻(xiàn)量 系統(tǒng)中相關(guān)文獻(xiàn)總量,查準(zhǔn)率 =,查全率 =,,,×100%,×100%,數(shù)據(jù)庫(kù)（Database）是能滿足某種特定目的或某一特定數(shù)據(jù)處理系統(tǒng)需要的一種數(shù)據(jù)集合，它可以由一個(gè)或多個(gè)文檔組成。文檔（File）是數(shù)

17、據(jù)庫(kù)中一部分記錄的集合。記錄（Record）是數(shù)據(jù)庫(kù)中的基本文獻(xiàn)單元，一條記錄往往記錄著一篇文獻(xiàn)的相關(guān)信息。字段（Field）是組成記錄的基本信息單元。每一個(gè)字段都描述文獻(xiàn)的某一方面的特征，包括外表特征和內(nèi)容特征，如題名、作者、刊名、出版年、主題詞等等。各個(gè)描述文獻(xiàn)一部分特征的字段組合就成了記錄。,數(shù)據(jù)庫(kù)及其結(jié)構(gòu),數(shù)據(jù)庫(kù),,文檔,記錄→字段（如題名、作者、主題詞、摘要等）記錄→字段……,,數(shù)據(jù)庫(kù)及其結(jié)構(gòu),文檔……索引索引

18、……,,每條記錄由若干個(gè)字段組成,計(jì)算機(jī)信息檢索主要技術(shù),布爾邏輯檢索位置檢索截詞檢索指定字段檢索,布爾邏輯檢索,布爾邏輯檢索是檢索系統(tǒng)中應(yīng)用最為廣泛的檢索技術(shù)，是最簡(jiǎn)單、最基本的匹配模式，其理論基礎(chǔ)是集合論與布爾邏輯。布爾邏輯檢索采用布爾邏輯表達(dá)式來(lái)表達(dá)用戶的檢索要求。布爾邏輯表達(dá)式是指通過(guò)布爾邏輯運(yùn)算符來(lái)連接檢索詞，以及表示運(yùn)算優(yōu)先級(jí)的括號(hào)組成的一種表達(dá)檢索要求的算式。例： （肺癌 or 肺腫瘤）and 手術(shù),常用的邏輯

19、運(yùn)算符有：邏輯“與” （and）邏輯“或” （or）邏輯“非” （not）,布爾邏輯檢索,布爾邏輯運(yùn)算符,1. 邏輯“與” ：是具有概念交叉關(guān)系和限定關(guān)系的一種組配（通常用 and 表示）。,檢索式A and B，表示檢出的文獻(xiàn)中必須同時(shí)包含檢索詞A和B。其作用是縮小檢索范圍，提高查準(zhǔn)率。,例：青霉素 and 肺炎,2. 邏輯“或” ：是具有概念并列關(guān)系的一種組配（通常用 or 表示）。,檢索式A or B ，表示檢出的是含

20、有檢索詞A或檢索詞B，或同時(shí)含有A和B的文獻(xiàn)。其作用是擴(kuò)大檢索范疇，提高查全率。,例：乙肝 or 乙型肝炎,布爾邏輯運(yùn)算符,3. 邏輯“非”：是具有不包含某種概念關(guān)系的一種組配 （通常用“not”或 “and not”表示）。,檢索式A not B，表示檢出文獻(xiàn)只包含檢索詞A而不包含檢索詞B。其作用是縮小檢索范圍。,例：阿霉素 not 表阿霉素,布爾邏輯運(yùn)算符,位置檢索（又稱相鄰度檢索、鄰近檢索）：檢索時(shí)通過(guò)位置算符（又稱鄰近算符）規(guī)定

21、檢索詞之間在原始文獻(xiàn)中的相鄰位置關(guān)系。位置算符都隱含了邏輯算符AND的含義，即由它們連結(jié)的兩個(gè)檢索詞（式）都必須出現(xiàn)，但位置算符還對(duì)連結(jié)的兩個(gè)檢索詞的位置關(guān)系作了進(jìn)一步的限定。,位置檢索,位置檢索大致包括三種級(jí)別的檢索：字段級(jí)檢索：限定檢索詞在同一字段范圍內(nèi)，如with（Medline光盤數(shù)據(jù)庫(kù)）；子字段或自然句級(jí)檢索：限制檢索詞在同一子字段或自然句中，如near（Medline光盤數(shù)據(jù)庫(kù)）；詞位置檢索：限定檢索詞的相互位置滿足

22、某些條件，如彼此相隔多少個(gè)詞（或字），是否以一定的先后順序出現(xiàn)，一個(gè)詞的出現(xiàn)是否不允許另一個(gè)詞（或字）同時(shí)出現(xiàn)等，如nW、pre（ScienceDirect）。,位置檢索,liver with cancer,,liver and cancer,,liver near4 cancer,,截詞檢索是在檢索時(shí)針對(duì)檢索詞附加一個(gè)截?cái)喾?hào)，指明該檢索詞在與文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫(kù)的詞比較時(shí)，采取完整匹配還是部分匹配。截詞符分為無(wú)限截?cái)嗪陀邢藿財(cái)?。無(wú)限截?cái)啵?/p>

23、一個(gè)截詞符代表多個(gè)字符，常用截詞符 “*”。有前截?cái)?、中截?cái)?、后截?cái)嘀?。后截詞符：如: vaccin*,可以查出vaccine; vaccines; vaccination; post-vaccinal 等。,截詞檢索,有限截?cái)啵阂粋€(gè)截詞符只能代表一個(gè)字符，常用截詞符 “?”（又稱通配符）。例：環(huán)孢?素，可以查出環(huán)孢霉素、環(huán)孢菌素；Leukemi?，可以查出Leukemia、Leukemic、Leukemid等。,截詞檢索,指