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文檔簡介
1、固態(tài)納米孔能夠應(yīng)用于檢測、分析生物分子,甚至識別DNA堿基序列,納米孔測序技術(shù)也被認(rèn)為是第三代測序技術(shù)中最具競爭力的測序手段。本文以解決納米孔測序技術(shù)的難題為最終目標(biāo),設(shè)計、搭建納米孔測試平臺,開展納米孔內(nèi)離子與DNA分子輸運(yùn)特性研究,并提出一種多模式測序方法。具體的工作與成果如下:
1)通過測量不同直徑納米孔在不同濃度KCl溶液中的I-V曲線,研究了電解質(zhì)溶液處于納米尺度受限空間內(nèi)的流變特性。發(fā)現(xiàn)電導(dǎo)率在低濃度時(≤0.01
2、mol/L)偏離體態(tài)值,提出低濃度時電導(dǎo)率主要由孔內(nèi)電荷密度決定的觀點。同時發(fā)現(xiàn)納米通道內(nèi)的離子遷移率異于體態(tài)值,錐形孔的整流效應(yīng)對離子輸運(yùn)也有影響。提出為了避免DNA分子過孔概率降低,需要有效降低壁面電荷密度的必要性。
2)通過改變納米孔兩側(cè)鹽溶液的濃度以及外加偏壓的大小,研究其對DNA的過孔時間以及信噪比的影響。發(fā)現(xiàn)九-DNA的過孔時間(tD)以及電流堵塞信號(IB)都隨著KCl濃度的升高而增加;但是,當(dāng)保持cis端的KC
3、l溶液濃度不變,trans端的KCl溶液濃度由1mol/L減小為0.1mol/L時,相對阻塞電流(IB/I0)增加了一個數(shù)量級;外加偏壓增大,DNA過孔時IB和IB/I0也增大,但是tD隨電壓的升高而縮短。因此,改變納米孔兩側(cè)鹽溶液的濃度以及外加偏壓能夠有效地降低DNA的過孔速度,并且通過在納米孔兩端形成濃度梯度可以大大提高信噪比。
3)研究了DNA分子通過納米孔時的過孔行為。對比實驗結(jié)果發(fā)現(xiàn),當(dāng)納米孔直徑較大時,DNA除了被
4、拉直過孔,還存在折疊過孔以及多個DNA分子同時過孔的情況。
4)提出一種三通道并行檢測的DNA測序手段,結(jié)合原子力顯微鏡(AFM),同時對DNA過孔時產(chǎn)生的堵塞離子電流、牽引DNA過孔的力信號和基于場效應(yīng)管放大的隧穿電流信號進(jìn)行檢測。本文先嘗試同時檢測前兩種信號,證實了并行檢測手段切實可行,并成功實現(xiàn)了對DNA分子的多元化檢測以及DNA分子過孔事件的主動控制,將DNA分子的過孔速度控制在遠(yuǎn)小于1base/ms,已經(jīng)完全能夠滿足
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