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1、中國(guó)科學(xué)技術(shù)大學(xué)碩士學(xué)位論文柔性對(duì)接算法用于環(huán)糊精對(duì)客體分子的分子識(shí)別和手性識(shí)別的研究姓名:姚雪霞申請(qǐng)學(xué)位級(jí)別:碩士專(zhuān)業(yè):應(yīng)用化學(xué)指導(dǎo)教師:潘忠孝蔡文生2003.5.1合;此外,B。環(huán)糊精對(duì)結(jié)構(gòu)相似的甾類(lèi)化合物具有很好的分子識(shí)別能力。進(jìn)一步分析顯示,甾類(lèi)化合物的立體效應(yīng)、溶解性和環(huán)糊精空腔的尺徑大小可能是影響分子識(shí)別的主要因素。5將柔性對(duì)接算法運(yùn)用于B一環(huán)糊精和單氨基取代p一環(huán)糊精與氨基酸衍生物以及苯的衍生物之間的手性識(shí)別研究。計(jì)算結(jié)果
2、表明:柔性對(duì)接算法所得到的經(jīng)驗(yàn)結(jié)合自由能變化能夠用于識(shí)別D/L型氨基酸對(duì)映體和R/S型苯的衍生物對(duì)映體:對(duì)于帶負(fù)電荷手性客體分子,帶正電荷氨基酸取代B一環(huán)糊精比天然的B環(huán)糊精具有更好的手性識(shí)別作用。進(jìn)一步分析各能量項(xiàng)表明:靜電相互作用,特別是其中的氫鍵對(duì)于旋光異構(gòu)體之間的識(shí)別起主要作用。通過(guò)以上研究,得出結(jié)論:(1)白行研制的柔性對(duì)接算法FDOCK是一種很有效的分子對(duì)接算法,結(jié)合所建立的理論模型,F(xiàn)DOCK可以用于環(huán)糊精和復(fù)雜客體分子之
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