珍稀泌鹽植物長葉紅砂SSR分子標(biāo)主的開發(fā)及種群遺傳學(xué)研究.pdf

1、長葉紅砂（Reaumuria trigyna）隸屬于檉柳科(Tamaricaceae)紅砂屬(Reaumuria)，屬中國特有種，僅分布于中國的內(nèi)蒙古及寧夏地區(qū)，為強旱生耐鹽小灌木，被認(rèn)定為古地中海珍稀孑遺植物。生境片段化是長葉紅砂面臨的生存威脅之一，使得長葉紅砂原本連續(xù)的大種群變成多個孤立的小種群，種子擴散和種群的建立受到限制，對其種群間基因交流和移居活動產(chǎn)生直接障礙，加速種群數(shù)量的下降，開展長葉紅砂種群遺傳學(xué)研究，有助于深入了解長葉

2、紅砂進化潛力及適應(yīng)機制。本研究利用從長葉紅砂轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)中開發(fā)出的10個SSR標(biāo)記，選取長葉紅砂分布區(qū)10個種群（其中內(nèi)蒙古7個種群，寧夏3個種群）為研究對象，對10個種群的200個長葉紅砂個體進行種群遺傳多樣性和遺傳結(jié)構(gòu)研究，分析其進化潛能及生存風(fēng)險，為進一步開展該植物保護生物學(xué)奠定基礎(chǔ)。
　　本研究主要內(nèi)容包括：⑴在長葉紅砂耐鹽轉(zhuǎn)錄組深度測序基礎(chǔ)上搜索并篩選出10個具有多態(tài)性的SSR位點。利用長葉紅砂中的10對多態(tài)性引物在紅砂基

3、因組DNA中進行引物通用性鑒定，得出Unigene7818、Unigene32181、Unigene27927三對引物在紅砂中鑒定效果明顯，可以應(yīng)用于紅砂研究中。⑵對10個SSR位點進行中性位點檢驗，結(jié)果顯示在95％的置信區(qū)間內(nèi)，7個位點為中性進化位點，3個位點為平衡選擇作用位點。⑶10對SSR引物共檢測出29個多態(tài)性位點，各個SSR位點的多態(tài)性信息含量值變化范圍從0.2352到0.5019，其中(GCT)6位點的為高度多態(tài)性標(biāo)記。⑷長

4、葉紅砂種群的遺傳多樣性分析顯示，長葉紅砂種群內(nèi)遺傳多樣性較低，種群內(nèi)遺傳變異大于種群間遺傳變異，各個種群間遺傳分化度較大，存在遺傳漂變和嚴(yán)重的近交現(xiàn)象。⑸采用STRUCTURE、UPGMA、PCA三個軟件對200個長葉紅砂個體進行聚類分析，研究結(jié)果均為所有個體分為兩個亞群，因此推測長葉紅砂的兩個亞群很可能是該物種在冰期避難所的殘留代表。⑹針對長葉紅砂生長現(xiàn)狀提出切實可行的保護措施:加強居民瀕危植物的保護意識，建立保護區(qū);定期在保護區(qū)內(nèi)播