黃鯽分子標(biāo)記開(kāi)發(fā)及遺傳多樣性分析.pdf

1、黃鯽(Setipinna taty),俗名麻口前、毛口國(guó)、黃鰶、雞毛鰳,隸屬于脊索動(dòng)物門(mén),硬骨魚(yú)綱,鯡形目(Clupeiformes),鳀科(Engraulidae),黃鯽屬(Setipinna);常棲息于淤泥底質(zhì)、水流較緩的海區(qū),白天棲息的水層較深,夜晚上浮表層;主要分布于印度洋、太平洋西部,在我國(guó)的主要分布海域?yàn)闁|海、黃海、渤海。
　　黃鯽是東海區(qū)春冬季海洋漁業(yè)的主要捕撈對(duì)象,其漁獲量及比例不可忽視,隨著捕撈強(qiáng)度的增大,不少地

2、區(qū)開(kāi)始重視對(duì)黃鯽漁業(yè)資源的開(kāi)發(fā)利用,為了準(zhǔn)確評(píng)估黃鯽的種質(zhì)資源現(xiàn)狀,我們需要對(duì)黃鯽的種質(zhì)資源進(jìn)行具體調(diào)查和分析。
　　本研究開(kāi)發(fā)了11個(gè)黃鯽特異的多態(tài)性微衛(wèi)星標(biāo)記,根據(jù)已經(jīng)開(kāi)發(fā)的微衛(wèi)星標(biāo)記分析黃鯽遺傳結(jié)構(gòu)及遺傳多樣性水平。我們還獲得黃鯽線粒體基因組全序列,解析其線粒體基因組中編碼序列和非編碼序列的結(jié)構(gòu)和特征;基于黃鯽和鯡形目下的12種魚(yú)類的線粒體基因組全長(zhǎng),構(gòu)建鯡形目魚(yú)類的分子系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)。這些研究為黃鯽的種質(zhì)資源評(píng)估,分子輔助育種

3、等研究提供了候選標(biāo)記。
　　本研究主要結(jié)果如下:
　　1.微衛(wèi)星標(biāo)記的開(kāi)發(fā)和多態(tài)篩選:本研究利用FIASCO法構(gòu)建(CA)13黃鯽微衛(wèi)星 DNA富集文庫(kù),克隆測(cè)序,獲得38個(gè)含有微衛(wèi)星位點(diǎn)的序列,設(shè)計(jì)38對(duì)引物,經(jīng)過(guò)篩選優(yōu)化獲得11個(gè)具有黃鯽特異的多態(tài)性的微衛(wèi)星標(biāo)記。為黃鯽的種質(zhì)資源評(píng)估、分子輔助育種等研究提供了候選標(biāo)記。
　　2.群體遺傳多樣性及遺傳結(jié)構(gòu)的分析:利用黃鯽11個(gè)多態(tài)性微衛(wèi)星標(biāo)記分析東海海域舟山、象山、寧

4、海,及黃海海域煙臺(tái)、威海這5個(gè)群體的遺傳結(jié)構(gòu)及遺傳多樣性水平。結(jié)果顯示,11個(gè)多態(tài)位點(diǎn)平均等位基因?yàn)?.84,觀測(cè)雜合度和期望雜合度分別在0.3500~0.8421和0.5244~0.6244之間,表明11個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn)具有較高的雜合度,群體保持著豐富的遺傳多樣性。煙臺(tái)和舟山兩個(gè)群體的親緣關(guān)系最遠(yuǎn);煙臺(tái)和威海兩個(gè)群體的親緣關(guān)系最近。
　　3.線粒體基因結(jié)構(gòu)和排列順序的分析:黃鯽線粒體基因組全序列在基因排列順序、內(nèi)部結(jié)構(gòu)等,均類似于其