基于線粒體Cytb基因的皖南和大別山區(qū)尖頭鱥種群的遺傳變異.pdf

1、本文以皖南山區(qū)及大別山區(qū)的尖頭鱥(Rhynchocypris oxycephalus)種群為研究對象，利用線粒體DNA的Cytb基因序列首先分析了來自皖南山區(qū)的秋浦河、青弋江、長江、新安江和大別山區(qū)的淠河、皖河共6個流域、15個種群252尾尖頭鱥種群的遺傳多樣性及其遺傳分布格局，探討其種群歷史動態(tài)及演化歷史。其次，對來自秋浦河136個個體8個種群的尖頭鱥進行遺傳特點分析以及所測得樣本的遺傳距離與地理距離之間的關系。
　　本研究主要

2、內容包括：⑴在流域間空間尺度上，通過對來自皖南山區(qū)的秋浦河、青弋江、長江、新安江以及大別山區(qū)的淠河、皖河共6個流域、15個種群、252尾尖頭鱥標本進行線粒體Cytb基因序列(1022bp)分析，發(fā)現：序列變異位點180個，占17.6％，簡約信息位點(170個，占16.6%。所有樣品共檢測到25個單倍型，整體的單倍型多樣性(h)和核苷酸多樣性(pi)分別是0.904±0.008和0.04245±0.00098，其中5個群體的單倍型多樣性和

3、核苷酸多樣性為0。相關性分析結果顯示尖頭鱥各地理種群間的遺傳分化與地理距離未呈現顯著的相關性。系統發(fā)育樹分析結果顯示該區(qū)域內的尖頭鱥種群可劃分為4個不同的譜系，而分子變異分析(AMOVA)也顯示各地理種群存在明顯的遺傳分化格局?；贐EAST v1.8.0估算出皖南山區(qū)和大別山區(qū)尖頭鱥種群的最近共同祖先存在于更新世晚期的0.042 Mya。核苷酸錯配分布及Tajima's D和 Fu's Fs中性檢驗顯示，大約在0.147-2.372

4、Mya，研究區(qū)域內的部分群體和譜系經歷了群體擴張事件。上述結果表明，研究區(qū)域內尖頭鱥種群所呈現出的遺傳分化格局，主要與最近一次冰期-間冰期(第四紀時期)的氣候劇烈變化有關，而造山運動、水系重組等地質事件的影響較小。⑵在流域內空間尺度上，以皖南山區(qū)的秋浦河流域為研究區(qū)域，對該流域的8個尖頭鱥種群、136尾尖頭鱥標本的線粒體Cytb基因序列(1108bp)進行了分析，發(fā)現：序列變異位點84個，占7.6%，簡約信息位點12個，占1.1%。所有

5、樣品共檢測到23個單倍型，總體種群的平均單倍型多樣性和核苷酸多樣性分別為h=0.735±0.038，pi=0.02290±0.00173。系統發(fā)育樹顯示所有尖頭鱥樣本可劃分為2個明顯的譜系。分子變異分析(AMOVA)結果表明，把尖頭鱥種群按進化譜系來劃分是最適合的地理細分，其遺傳分布格局明顯。核苷酸錯配分布及Tajima’s D和 Fu’s Fs中性檢驗表明大部分群體并沒有經歷過近期擴張。相關性分析結果顯示，秋浦河尖頭鱥不同地理群體的遺