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文檔簡介
1、四川農(nóng)業(yè)大學(xué)博士學(xué)位論文岷山山系黑熊種群生存力分析及黑熊分子生物學(xué)初探姓名:侯萬儒申請學(xué)位級別:博士專業(yè):生物化學(xué)與分子生物學(xué)指導(dǎo)教師:任正隆20030501006l:4359只,09200064:4394只,09120073。15在近親繁殖、人類捕捉3%影響下,100年內(nèi)種群數(shù)量和基因雜合率動態(tài)分別為:2161只,099740002;2463只,097940015:2695只,O968003l:2893只,o9560041:2964只
2、,09440:051;3162只,0902006:3229只,0902006;3283只,091240074:3314只,090400793338只,08960079。16在近親繁殖、人類捕捉5%影響下。100年內(nèi)種群數(shù)量和基因雜合率動態(tài)分別為:1704只,09970002;1534只,0982440017;1374只,096340034:1200只,094340047:1028只,09210057;876只,089740073;729
3、只,08730088:607只,O8720058:487只,08560059:389只,08370067。17在近親繁殖、食物欠收和人類捕捉2%影響下,100年內(nèi)種群數(shù)量和基因雜合率動態(tài)分別為:2268只,09970002:2364只,09830014:2958只,09630029:3228只,095640037;3424只,09430049:3603只,09350052;3707只,09260057:3779只,091840036:3
4、825只09080076:3910只,086240077。18在近親繁殖、食物欠收和人類捕捉3%影響下100年內(nèi)種群數(shù)量和基因雜合率動態(tài)分別為:1905只,09970002;2039只,098240015:2142只,0966400302200只,095040042:2247只,09370048:2262只,09370048:2259只,091040065:2245只,08960069;2227只,08860071;2227只,0825
5、008l。19在近親繁殖、食物欠收和人類捕捉5%影響下,100年內(nèi)種群數(shù)量和基因雜合率動態(tài)分別為:1523只,O。997_40002;1301只,09820014;1081只,09580038:981只。09340050:713只,O9160047:555只,08800085;426只,08440116:319只,08190117;230只,08070114:162只,07890109。2黑熊分子生物學(xué)初步研究結(jié)果:本實驗采用人類x染色
6、體上的15對粗掃描微衛(wèi)星標記(GATAl75D03DXS9896GATAl44D04DXS6800GATAl82E04DXS9900DXS9895DXS6810DXS7132DXSl047DXYSl54DXS6797DX$6789GATAl65812DXSl068)引物和人類SSX、ALTE和IDH3G基因的序列位標(STSXSSX4stSG54512、ALTE—RH38668、IDH3GstSG47410);J[物對黑熊總基因組(DN
7、A)進行了PCR擴增。15對粗掃描微衛(wèi)星標記中有4對引物能擴增出產(chǎn)物,這4對引物的名稱分別是DXS9900、DXS9895、GATAl82E04和DXYSl54,其中DXS9895、GATAl82E04引物在黑熊中能分別擴增出大小和結(jié)構(gòu)各異的兩個DNA片段。SSX4stSG54512、ALTERH38668、lDH3GstsG47410這3對引物均能在黑熊DNA中擴增出產(chǎn)物。對擴增產(chǎn)物分gⅡ進行聚丙烯酰胺凝膠電泳和銀染,然后從聚丙烯酰胺
8、凝膠電泳膠片上回收DNA,分別進行克隆和測序。通過對擴增產(chǎn)物序列比較分析和Blast檢索發(fā)現(xiàn):21人類x染色體上這4對微衛(wèi)星標記引物在黑熊中所擴增的6個DNA片段,在性質(zhì)上不屬于重復(fù)序列。這6個DNA片段與相應(yīng)的標記模式序列相比,一是在長度上存在較大差異;二是在結(jié)構(gòu)上也存在很大差異,即除兩端引物序列同源外,在兩引物之問的序列同源性特別低。這6個DNA片段經(jīng)Blast檢索,未能找到其片段全序的同源序列。由此初步認為:人類X染色體上的這4對
9、微衛(wèi)星引物在黑熊中所擴增的6個DNA片段具有黑熊特異性,在對黑熊核基因組的認識尚處空白的狀態(tài)下,這6個DNA片段可以作為黑熊的標記序列。這6個序列:序列1、序列2、序列3、序列4、序列5和序列6可暫時分別命名為BlackbearDXS9900、BlackbearDXS98951、BlackbearDX898952、BlackbearGATAl82E04l、BlackbearG^M182E042和BlackbearDXSl54。22人類S
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