利用微衛(wèi)星標(biāo)記分析不同地理亞群香螺群體的遺傳多樣性.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、香螺(Neptunea cumingi Crosse)屬軟體動物門(Mollusca)、腹足綱(Gastropoda)、前腮亞綱(Prosobranchia)蛾螺科(Buccinidae)、香螺屬(Neptunea),主要分布在黃、渤海海域。雖然國內(nèi)、外對海洋動物的遺傳多樣性有較多研究,但國內(nèi)仍未見有利用微衛(wèi)星DNA分子標(biāo)記研究香螺的遺傳多樣性相關(guān)方面的報道。 本文采用SSR分子標(biāo)記方法對黃、渤海海域遼寧地區(qū)的旅順(LS)、東港

2、(DG)、莊河(ZH)、長海(CH)以及山東煙臺地區(qū)(SD)五個地理亞群野生群體的香螺的遺傳多樣性和種群遺傳結(jié)構(gòu)進(jìn)行了研究。實驗共篩選了33對引物,從中篩選出11對引物可增出條帶,其中8對多態(tài)性相對較好的引物,片段大小為150-375bp之間,3對為單態(tài)性。對五個地理亞群的94個個體進(jìn)行了研究。利用Arlequin3.11軟件分析了群體內(nèi)的遺傳變異和群體間的遺傳結(jié)構(gòu),計算不同地理種群的遺傳距離,用UPGMA法和NJ法構(gòu)建了五個群體的系統(tǒng)

3、發(fā)生樹。每對引物檢測出的等位基因數(shù)為2-4不等,平均每對引物2.750個。觀測雜合度在0.173-0.865。分析時發(fā)現(xiàn),群體總的觀測雜合度(Ho=0.594)明顯高于期望雜合度值(He=0.518),存在雜合度過剩的現(xiàn)象。五個地理亞群野生群體香螺的遺傳相似系數(shù)在0.858-0.992之間,遺傳距離0.008-0.164之間,亞群間具有較大的相似性。由SSR擴(kuò)增得到的亞群間的Fst在0.006-0.188之間,平均值為0.066,基因流

4、(Nm)在2.239-89.283之間,平均值為25.400。遺傳分化指數(shù)表明,在不同群體間已產(chǎn)生了遺傳分化,但是分化較小。AMOVA分析數(shù)據(jù)表明亞群間的遺傳變異指數(shù)為3.334%,個體間的遺傳變異指數(shù)為95.516%,基因分化主要發(fā)生在亞群內(nèi),而不是亞群之間。根據(jù)所構(gòu)建的4個SSR-PCR聚類圖顯示:地理位置相對最遠(yuǎn)的山東(SD)亞群被分為一支,遼寧的4個亞群聚為了一支。通過比較發(fā)現(xiàn),基因流水平的高低、遺傳相似性的程度和亞群之間的地理

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