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文檔簡介
1、microRNA(miRNA,微小RNA)是近年來新發(fā)現(xiàn)的一類非編碼RNA,它在諸多重要生命過程中起著關鍵的調(diào)控作用,人們對其在疾病的診斷和治療等方面的應用前景寄予厚望。microRNA的研究是涉及計算機技術、生物信息學、智能計算等領域的跨學科前沿方向之一,正引起學者們的廣泛關注。本文在分析了有關疾病相關的microRNA文獻的基礎上,著重探討了microRNA與疾病的關系,完成了相關的特征數(shù)據(jù)庫管理系統(tǒng)的開發(fā)及microRNA的預測方
2、法研究。主要完成的工作如下:
首先,由于研究microRNA與癌癥之間的關系需要大量的數(shù)據(jù),而這些數(shù)據(jù)的類型不一、關系復雜,尤其是數(shù)據(jù)的冗余性、不一致性等問題、不利于后續(xù)的研究工作。因此,針對癌癥相關的microRNA生物數(shù)據(jù),特別是對癌癥具有重要調(diào)控作用的microRNA進行了研究。在分析有關microRNA與疾病文獻資料的基礎上,從已有的文獻中獲得并整理出已知疾病與microRNA關聯(lián)的信息,例如microRNA名字、基因
3、表現(xiàn)型、疾病類型、microRNA在疾病中的調(diào)控作用信息等。
然后,將整理完成后的數(shù)據(jù)按照一定的格式進行規(guī)范化處理,使其必須包含microRNA與疾病的各自的信息以及二者之間存在的關系。為了便于對這些數(shù)據(jù)進行存儲、瀏覽、查詢、提取和分析等,在Visual Studio.NET 2008平臺下建立了疾病相關的microRNA特征數(shù)據(jù)庫與查詢網(wǎng)站HMMD,并利用疾病相關的microRNA數(shù)據(jù)庫HMMD分析了microRNA對癌癥的
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