三種笛鯛屬魚類野生和養(yǎng)殖群體的SSR和D-loop序列分析.pdf

1、本文采用SSR標(biāo)記和D-loop序列分析兩種分子遺傳標(biāo)記的方法，分析南海海域紅鰭笛鯛(Lutjanus erythopterus)、星點(diǎn)笛鯛(Lutjanus.stellatus)和紫紅笛鯛(Lutjanusargentimaculatus)野生和養(yǎng)殖群體的遺傳多樣性及群體分化水平。所用10對(duì)微衛(wèi)星引物來(lái)自郭昱嵩篩選的勒氏笛鯛微衛(wèi)星引物，在6個(gè)笛鯛群體中共檢測(cè)到了78個(gè)等位基因，除Lru020在星點(diǎn)笛鯛中表現(xiàn)為單態(tài)外，其余均表現(xiàn)為多態(tài)，

2、不同座位上的等位基因數(shù)為3～18個(gè)，平均每個(gè)座位上的等位基因數(shù)為7.8個(gè)，養(yǎng)殖群體的等位基因數(shù)目較野生笛鯛群體均有所下降。6個(gè)笛鯛群體的多態(tài)信息含量(polymorphism information content)為0.3797～0.5922，觀測(cè)雜合度(observed Heterozyg-osity)為0.9550～0.8100，紅鰭笛鯛、星點(diǎn)笛鯛和紫紅笛鯛的野生群體多態(tài)信息含量分別為0.5922，0.4584，0.5414，高于

3、養(yǎng)殖群體的0.5032，0.3797，0.4300。SSR標(biāo)記群體遺傳變異說(shuō)明三種笛鯛養(yǎng)殖和野生群體遺傳多樣性豐富，野生群體多樣性高于養(yǎng)殖群體，野生和養(yǎng)殖群體間遺傳分化系數(shù)為0.0371～0.1029，顯示三種笛鯛的野生和養(yǎng)殖群體間遺傳分化程度較弱。采用PCR擴(kuò)增并測(cè)定了6個(gè)笛鯛群體共48個(gè)個(gè)體的D-loop全序列，序列長(zhǎng)849bp，A+T(62.1％)含量明顯大于大C+G(37.9％)的含量。共檢測(cè)到35種單倍型，6個(gè)群體的單倍型多樣

4、性為0.8570～1，群體內(nèi)核苷酸多樣性水平(Pi)平均為0.0130～0.0446，平均核苷酸差異數(shù)(K)為10.680～36.7500，三種笛鯛養(yǎng)殖和野生群體遺傳多樣性水平較高。紅鰭笛鯛、星點(diǎn)笛鯛和紫紅笛鯛的野生群體的核苷酸多態(tài)性指數(shù)分別為0.0130，0.0169，0.0446，高于養(yǎng)殖群體的0.0128，0.0161，0.0342。檢測(cè)到群體的總變異位點(diǎn)數(shù)為396個(gè)，其中有321個(gè)多態(tài)位點(diǎn)，含簡(jiǎn)約信息位點(diǎn)占298個(gè)，占總序列的9