飼糧和品種對(duì)山羊瘤胃微生物多樣性的影響.pdf

1、SichuanAgriculturalUniversityThesisTheimpactofrationandgoatbreedsonthesitioandtherelativelbundanceJfcompositionantllerelativeaUnanceOl‘’●’●●Jmicrobialspeclesin90atrumenByQinXuDirectedbyAssociateProfLizhiWang，AndProfTianh

2、aiYanMajor：AnimalNutritionandFeedScienceResearchdirection：RuminantNutritionYa’an，SichuanProvince，REChina，6250145，2015摘要反芻動(dòng)物擁有非常特殊的消化系統(tǒng)，其瘤胃內(nèi)定植了高密度的微生物，能夠降解植物纖維，為宿主提供可吸收的營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)，一旦瘤胃內(nèi)微生物組成發(fā)生了改變，將會(huì)直接影響動(dòng)物正常的生理功能，甚至引發(fā)某些疾病。有研究發(fā)現(xiàn)，

3、飼糧和品種是影響瘤胃微生物多樣性的重要影響因素，但以往的研究缺乏一種高效、低成本的測(cè)定微生物序列的方法，新興技術(shù)高通量測(cè)序方法能夠通過(guò)深度測(cè)序獲得樣品中絕大部分微生物的序列，因此，本研究采用最新高通量測(cè)序技術(shù)對(duì)比了不同飼糧以及不同品種對(duì)山羊瘤胃微生物多樣性的影響。試驗(yàn)一通過(guò)全價(jià)料(CF)和全粗料(AF)兩個(gè)飼糧處理組6只山羊，采用單因素22拉丁方設(shè)計(jì)來(lái)研究不同的飼糧對(duì)山羊瘤胃內(nèi)微生物多樣性的影響，每只羊單籠飼養(yǎng)，自由飲水，預(yù)飼期14d，

4、正式試驗(yàn)期7天，在試驗(yàn)期最后一天采樣，第一期試驗(yàn)結(jié)束后，原AF組山羊轉(zhuǎn)為飼喂CF組飼糧，原CF組山羊轉(zhuǎn)為飼喂AF組飼糧，然后進(jìn)行下一期試驗(yàn)。提取樣品總DNA，并采用最新高通量測(cè)序技術(shù)miseq測(cè)序平臺(tái)以及細(xì)菌古菌通用引物515f／806r對(duì)瘤胃微生物16SrRNA的V4區(qū)域進(jìn)行測(cè)序，利用QIIME軟件對(duì)測(cè)序結(jié)果進(jìn)行分析，結(jié)果發(fā)現(xiàn)兩個(gè)處理組中擬桿菌門和厚壁菌門是山羊瘤胃內(nèi)優(yōu)勢(shì)菌，瘤胃球菌屬、Lachnospiraceaincertaese

5、dis等纖維降解菌的相對(duì)含量隨著飼糧纖維含量的升高而顯著增加，與之相對(duì)，假單胞菌屬、厭氧弧菌屬等隨著飼糧中蛋白和脂肪的升高而顯著增加。雖然兩個(gè)飼糧處理組微生物群落組成差異較大，但是普氏菌屬、丁酸弧菌屬和假丁酸弧菌屬等核心菌群在飼糧處理組間的差異并不顯著。說(shuō)明飼糧的變化對(duì)于這類瘤胃核心菌群的影響相對(duì)較小。另外weighteduniffac距離矩陣表明CF組和AF組組內(nèi)相似性分別為6276％和6794％，組間相似性為6199％士708。PC

6、oA聚類圖表明各個(gè)樣本大致根據(jù)自己所在處理組的不同而相互聚集在一起。試驗(yàn)二采用高通量測(cè)序技術(shù)以及細(xì)菌／古菌通用引物(515f／806r)研究品種對(duì)山羊瘤胃微生物多樣性的影響，本研究利用6只波雜山羊(B組)以及6只南江黃羊(N組)作為實(shí)驗(yàn)對(duì)象，每只羊單籠飼養(yǎng)，自由飲水，兩組均自由采食黑麥草，預(yù)飼期14d，正式試驗(yàn)期7天，在試驗(yàn)期最后一天采樣，提取樣品總DNA、測(cè)序、軟件分析同試驗(yàn)一，結(jié)果顯示擬桿菌門和厚壁菌門這兩個(gè)優(yōu)勢(shì)菌門在兩個(gè)處理組中相