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文檔簡介
1、稻縱卷葉螟(Cnaphalocrocis medinalis Guenée)(Rice leaf folder, RLF)是一種世界范圍內(nèi)危害水稻、大麥、小麥、甘蔗等作物的重要害蟲。腸道微生物在宿主的食物消化、生長發(fā)育、免疫以及代謝方面起著重要的作用,近年來新一代測序技術(shù)大大推動(dòng)了腸道微生物的研究。為分析稻縱卷葉螟腸道微生物對宿主的功能,本文綜合運(yùn)用傳統(tǒng)微生物培養(yǎng)技術(shù)、變性梯度凝膠電泳技術(shù)(DGGE)、16S rRNA基因測序技術(shù)以及宏
2、基因組測序技術(shù)對稻縱卷葉螟腸道細(xì)菌多樣性及其功能進(jìn)行了分析,
本研究主要內(nèi)容包括:⑴采用傳統(tǒng)微生物培養(yǎng)方法,共分離得到10種不同的細(xì)菌,其中變形菌門 Proteobacteria和厚壁菌門 Firmicutes所占比例分別為70%和30%,表明變形菌門為稻縱卷葉螟腸道可培養(yǎng)細(xì)菌中的優(yōu)勢菌群。采用 DGGE方法,分離得到的變形菌門所占比例為77%,厚壁菌門所占比例為23%,在門的水平上腸道微生物的組成與傳統(tǒng)微生物培養(yǎng)方法一致。利
3、用16S rRNA基因測序技術(shù)分析稻縱卷葉螟腸道細(xì)菌組成,結(jié)果表明,稻縱卷葉螟腸道細(xì)菌主要由變形菌門(55.2%)和擬桿菌門Bacteroidetes(6.2%)組成,其中變形菌門主要由假單胞菌目Pseudomonadales(16.9%)、黃色單胞菌目Xanthomonadales(8.3%)、立克次氏體目Rickettsiales(4.9%)和腸桿菌目Enterobacteriales(4.6%)組成;擬桿菌門主要是由鞘脂桿菌目Sp
4、hingobacteriales(4.3%)和擬桿菌目Bacteroidales(1.1%)組成。利用宏基因組測序技術(shù)分析稻縱卷葉螟腸道細(xì)菌多樣性,結(jié)果表明稻縱卷葉螟腸道細(xì)菌豐度最高的是變形菌門(89%),其次是厚壁菌門(8%)。其中變形菌門主要是由腸桿菌目(65%)、立克次氏體目(23%)和假單胞菌目(4%)組成;厚壁菌門主要是由芽孢桿菌目 Bacillales(5%)組成。綜合上述四種方法發(fā)現(xiàn),稻縱卷葉螟腸道細(xì)菌的多樣性在門的分類水
5、平上是一致的,但是在(綱、目、科、屬)分類水平上,利用16S rRNA基因測序技術(shù)和宏基因組測序技術(shù)的分析結(jié)果存在一些差別。⑵利用16SrRNA基因測序技術(shù)分析不同品系水稻(明恢82、明恢2155、甬優(yōu)15)對稻縱卷葉螟腸道細(xì)菌多樣性的影響。結(jié)果表明,取食三個(gè)品系水稻的稻縱卷葉螟腸道細(xì)菌主要由黃色單胞菌目、假單胞菌目、立克次氏體目、腸桿菌目組成。假單胞菌目和腸桿菌目的相對豐度在三個(gè)品系之間均存在顯著性差異,黃色單胞菌目和立克次氏體目的相
6、對豐度在明恢82與甬優(yōu)15品系間和明恢2155與甬優(yōu)15品系間存在顯著性差異,表明食物改變了稻縱卷葉螟腸道細(xì)菌的相對豐度。⑶利用16SrRNA基因測序技術(shù)分析轉(zhuǎn)crylAb基因水稻對稻縱卷葉螟腸道細(xì)菌多樣性的影響,結(jié)果表明,轉(zhuǎn) crylAb基因水稻顯著影響稻縱卷葉螟腸道細(xì)菌的相對豐度。其中γ-變形菌綱、腸桿菌目、腸桿菌科、腸桿菌屬在處理組中的相對豐度均大于對照組,這可能是由于Bt毒素破壞了腸道內(nèi)環(huán)境,機(jī)體的正常代謝紊亂,而這些菌在維持機(jī)
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