不同飼養(yǎng)模式對(duì)豬腸道菌群結(jié)構(gòu)的影響研究.pdf

1、不同的飼養(yǎng)環(huán)境是影響豬腸道菌群多樣性的重要因素，腸道菌群結(jié)構(gòu)在豬免疫防御、營養(yǎng)代謝等方面起到至關(guān)重要的作用。目前林下養(yǎng)殖和圈舍養(yǎng)殖模式較為流行，但關(guān)于飼養(yǎng)模式對(duì)豬腸道菌群結(jié)構(gòu)的作用與特點(diǎn)等相關(guān)研究卻甚少，影響這些模式在市場上的有效推廣和實(shí)踐應(yīng)用。
　　本研究選擇林下養(yǎng)殖和圈舍養(yǎng)殖兩種肥育豬飼養(yǎng)模式，其中圈養(yǎng)采用場方常規(guī)水泥地飼養(yǎng)形式，選擇常規(guī)飼糧，林下養(yǎng)殖模式采用結(jié)合補(bǔ)飼常規(guī)飼糧;供試豬選擇淮豬(H)和杜長大(DLY)雜交豬，供試

2、豬試驗(yàn)開始前進(jìn)行去勢、驅(qū)蟲和防疫處理;試驗(yàn)期3個(gè)月，90kg-100kg體重屠宰時(shí)采集圈舍養(yǎng)殖和林下養(yǎng)殖兩種模式的淮豬(H)和杜長大(DLY)雜交豬各3份（共12份）腸道糞便樣本，利用試劑盒提取基因組DNA，通過Illumina高通量測序技術(shù)對(duì)16s rDNA基因的V4可變區(qū)進(jìn)行測序并分析。
　　研究表明:
　　1.淮豬腸道菌群由15個(gè)門，15個(gè)綱，18個(gè)目，27個(gè)科，31個(gè)屬的細(xì)菌群落組成，三元雜交豬由16個(gè)門，17個(gè)綱，

3、19個(gè)目，29個(gè)科，32個(gè)屬細(xì)菌群落組成。兩種豬的豬腸道菌群具有明顯的差異性，三元雜交豬比淮豬的腸道菌群更具有多樣性。
　　2.不同飼養(yǎng)模式豬腸道糞便微生物具有較高的多樣性，所有樣本共檢測出1133個(gè)物種。林下養(yǎng)殖豬腸道菌群由15個(gè)門，17個(gè)綱，19個(gè)目，29個(gè)科，32個(gè)屬的細(xì)菌群落組成，圈養(yǎng)的豬腸道菌群由15個(gè)門，17個(gè)綱，18個(gè)目，27個(gè)科，29個(gè)屬的細(xì)菌群落組成。兩種飼養(yǎng)模式下的豬腸道菌群差異明顯，林下散養(yǎng)的豬比圈養(yǎng)的豬腸道

4、菌群更具有多樣性。
　　3.檢測獲得的菌群主要分15大門:擬桿菌門(Bacteroidetes)、厚壁菌門(Firmicutes)、放線菌(Actinobacteria)、擬桿菌(Bacteroidetes)、衣原體(Chlamydiae)、梭菌門(Fusobacteria)、無壁菌類(Tenericutes)、疣微菌（Verrucomicrobia）和螺旋體門（Spirochaetes等，其中擬桿菌門、厚壁菌門比例最高，為腸道內(nèi)