從系統(tǒng)生物學水平研究白血病治療的分子機制.pdf

1、本文為了揭示這一高效治療的復雜機制，我們應用系統(tǒng)生物學的理念和方法，通過整合基因芯片、二維凝膠電泳及質(zhì)譜分析等手段，對APL細胞株NB4分別用RA、ATO及RA/ATO進行處理，并收集不同時間段的樣本，對基因和蛋白的表達大規(guī)模地進行動態(tài)性的定量分析。 本文在此基礎(chǔ)上，我們發(fā)現(xiàn)了一系列與粒系分化及凋亡相關(guān)的分子調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的新特點，包括轉(zhuǎn)錄因子及輔助轉(zhuǎn)錄因子、鈣信號通路、干擾素通路、泛素-蛋白酶體系統(tǒng)的激活，PML-RARα蛋白的降解

2、和核體(NuclearBody)的重建，細胞周期阻滯及凋亡潛能的重新獲得等。 本文對于受RA調(diào)變的基因，我們還對其上游的轉(zhuǎn)錄調(diào)控序列進行轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合序列的頻率掃描、權(quán)重矩陣和概率模型分析等數(shù)理統(tǒng)計的處理，發(fā)現(xiàn)包括RARE(維甲酸反應元件)在內(nèi)的一些特定轉(zhuǎn)錄因子的結(jié)合序列在這些RA調(diào)變的基因中存在著富集分布的現(xiàn)象，從而在基因組水平對轉(zhuǎn)錄組及蛋白質(zhì)組的信息進行了有力的補充。 本文還觀察到：不同藥理濃度的RA對粒系分化相關(guān)的轉(zhuǎn)