青海省2000~2011年麻疹病毒的分子流行病學研究.pdf

1、目的：研究2000～2011年引起青海省麻疹流行的麻疹病毒的基因型特征，分析麻疹病毒的來源、傳播和基因分布，進一步累積并豐富青海省本土流行的麻疹病毒的基因和氨基酸變異資料，并及時發(fā)現(xiàn)可能的輸入病毒，為該地區(qū)進一步控制和消除麻疹提供科學依據(jù)。
　　 方法：使用淋巴信號激活因子轉染的非洲綠猴腎細胞（Vero/SLAM細胞）對麻疹疑似病例的咽拭子和/或尿標本進行病毒分離。經逆轉錄，聚合酶鏈反應(reversetranscriptpol

2、ymerasechainreaction，RT-PCR)方法對分離的麻疹病毒進行N基因羧基(carboxyl，COOH)末端676個核苷酸片段的擴增。通過對上述RT-PCR擴增產物進行核苷酸序列測定和分析，以N基因COOH末端450個核苷酸序列片段構建基因親緣性關系樹，并進行核苷酸和氨基酸同源性分析，分析與疫苗株S191、中國麻疹Hla代表株China9322N蛋白羧基末端150個氨基酸的變異及2000～2011年麻疹流行株間N蛋白羧基

3、末端150個氨基酸的變異。
　　 結果：青海省2000～2011年分離的19株麻疹野病毒，均為Hl基因型中的Hla基因亞型。19株Hla基因亞型麻疹野病毒N基因COOH末端序列分析結果顯示，它們之間的核苷酸同源性為96.0％～100％，氨基酸同源性為92.7％～100％;與Hla基因型代表株Chin9322的核苷酸同源性為97.1％～99.5％，氨基酸同源性為94.0％～99.3％:以中國麻疹疫苗株S191為基準，青海省2000

4、～2011年分離到的19株麻疹病毒共有32個氨基酸發(fā)生置換，置換率為21.3％(32/150)，有16個氨基酸位點全部發(fā)生變異，有16個位點為部分氨基酸變異；青海省2000～2011年分離到的19株麻疹病毒與中國麻疹Hla代表株China9322的氨基酸差異為1～8個，2009～2011年的10株麻疹病毒與China9322的氨基酸差異明顯增多；與2000～2005年的麻疹病毒流行株相比，2009～2011年的麻疹病毒N蛋白基因序列推導

5、的氨基酸均有共同的3個氨基酸變化，在422位點由甘氨酸(G)變異為絲氨酸(S)，在457位點由S變異為G，在497位點由精氨酸(R)變異為賴氨酸(K)。
　　 結論：青海省2000～2011年流行的麻疹野病毒仍以本土基因亞型Hla為絕對優(yōu)勢基因亞型，未發(fā)現(xiàn)Hlb和Hlc亞型；2000～2005年分離到的的麻疹病毒在同一小分支，形成傳播鏈1,2009-2011年分離到的麻疹病毒在另一小分支，形成傳播鏈2。隨著年份增加，19株麻疹病