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文檔簡介
1、牡丹為異花授粉植物,自交結(jié)實(shí)率很低,這一特性為人工選擇和自然選擇提供了豐富的變異來源。經(jīng)過長期的馴化栽培,不僅形成了類型多樣的品種,而且品種間的親緣關(guān)系也較為復(fù)雜。因此在遺傳上進(jìn)行分類鑒定和親緣關(guān)系的探討不僅對(duì)揭示物種的演化有重要意義,而且有利于指導(dǎo)牡丹新品種選育及傳統(tǒng)品種的保護(hù)等工作。
本實(shí)驗(yàn)采用AFLP(Amplified Fragment Length PolymorpHism)技術(shù)對(duì)28個(gè)牡丹品種進(jìn)行分子水平的親緣
2、關(guān)系及遺傳多樣性研究。首先采用改良的CTAB法從牡丹幼葉中提取到了高質(zhì)量的基因組DNA,用于AFLP的雙酶切,酶切完全;然后對(duì)牡丹AFLP選擇性擴(kuò)增體系進(jìn)行優(yōu)化,建立最佳反應(yīng)體系,篩選出適合牡丹AFLP分析的引物組合進(jìn)行擴(kuò)增。最后,對(duì)樣品的AFLP圖譜及數(shù)據(jù)進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析,結(jié)果如下:
1.本實(shí)驗(yàn)采用改良的CTAB法從牡丹幼葉中提取基因組DNA,產(chǎn)率很高,OD260/OD280為1.8~2.0之間;經(jīng)過去RNA處理后,用瓊脂糖
3、凝膠電泳檢測(cè),主帶清晰、DNA純度高、沒有降解、不含酶反應(yīng)抑制劑,可被MseI和EcoRI兩種限制性內(nèi)切酶完全消化。
2.對(duì)牡丹酶切及選擇性擴(kuò)增體系進(jìn)行優(yōu)化,獲得了最佳反應(yīng)體系,酶切時(shí)最適溫度為37℃,限制性內(nèi)切酶用量為3U,酶切時(shí)間為3h;選擇性擴(kuò)增最優(yōu)體系為:預(yù)擴(kuò)增產(chǎn)物2μl,E-primer0.5μ1,M-primer0.5μl,Taq酶0.25μl,MgCl21.2μl, dNTPs1.6μl,10×Buffer2
4、μl, ddH2O11.95μl。
3.采用優(yōu)化后體系,對(duì)64對(duì)AFLP引物組合進(jìn)行篩選,經(jīng)過3次重復(fù),篩選出了6對(duì)擴(kuò)增條帶多、多態(tài)性高的引物組合。
4.利用篩選出的6對(duì)選擇性擴(kuò)增引物組合,對(duì)28個(gè)牡丹品種進(jìn)行了AFLP研究。6對(duì)引物共擴(kuò)增出譜帶2562條(100~750bp之間),其中2142條具有多態(tài)性,占83.61%。多態(tài)性譜帶最多的組合為E-AAC/M-CTA(88.19%),最低的為E-AAC/M-
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