甘蔗品種的AFLP和SSR標(biāo)記鑒定及其應(yīng)用.pdf

1、品種遺傳多樣性和指紋圖譜是育種、品種權(quán)保護(hù)和新品種推廣等工作的重要基礎(chǔ)。在雜交育種工作中，種質(zhì)資源的遺傳距離可以作為親本選擇的依據(jù)，親本間較高的遺傳距離可以提高 F1代中出現(xiàn)更強(qiáng)雜種優(yōu)勢的可能；品種權(quán)保護(hù)工作中DNA分子指紋可以作為品種的“身份證”，精確地判別品種的真實(shí)身份；品種推廣也需要鑒定組合推廣品種的遺傳背景以及新推廣品種與已大面積推廣品種之間的遺傳相似度，作為新品種推廣的指導(dǎo)。本研究利用9對AF LP引物和15對S S R引物掃

2、描38個來自國家甘蔗品種區(qū)域試驗(yàn)的甘蔗新品種（系）的全基因組，獲得這些品種（系）豐富的指紋數(shù)據(jù)，繼而分析鑒定甘蔗種質(zhì)資源遺傳多樣性、構(gòu)建甘蔗品種（系）的DNA分子指紋庫，預(yù)期能夠?yàn)楦收嵊N親本選擇提供分子水平的基礎(chǔ)數(shù)據(jù)。本研究得出的結(jié)果有如下幾點(diǎn)。
　?。?）AFLP標(biāo)記9對引物組合共擴(kuò)增出348個位點(diǎn)，多態(tài)性位點(diǎn)有248個，多態(tài)性比率為72.26％；S S R標(biāo)記15對引物共擴(kuò)增出180個位點(diǎn)，多態(tài)性位點(diǎn)有176個，多態(tài)性比率為

3、97.78%。通過NTSYS2.10e軟件計(jì)算，38個甘蔗新品種（系）遺傳相似系數(shù)分布在0.668~0.847間，由此可見這38個甘蔗新品種（系）遺傳背景接近；此外，兩種分子標(biāo)記技術(shù)引物的平均PIC值分別為0.971和0.920，說明這兩種標(biāo)記技術(shù)具有很高的品種鑒別力，對后續(xù)的群體遺傳基礎(chǔ)判定、群體劃分以及主成分分析等相關(guān)工作奠定了可靠的基礎(chǔ)。
　　（2）本研究創(chuàng)新使用箱線圖研究品種遺傳相似系數(shù)的分布特征，根據(jù)分布特征可以判定38

4、個甘蔗品種（系）的遺傳基礎(chǔ)。結(jié)果顯示，總體（ALL）38份甘蔗品種（系）和各系列（FN、MT、YZ、YG和G T）甘蔗品種（系）內(nèi)部的遺傳相似性系數(shù)分布范圍都在0.680~0.830之間，且均向0.725~0.770間集中。F N系列甘蔗品種（系）遺傳相似系數(shù)集中范圍與YZ系列甘蔗品種接近，并且與38個甘蔗品種（系）總體的相似系數(shù)集中范圍接近；另外，GT系列甘蔗品種（系）相比其他系列甘蔗品種（系），其遺傳相似系數(shù)集中范圍處在較低水平；Y

5、G系列甘蔗品種相比其他系列甘蔗品種，其遺傳相似系數(shù)集中范圍處在較高水平。
　?。?）通過UPGMA聚類算法對38個品種（系）進(jìn)行群體劃分。聚類分析顯示，在遺傳相似系數(shù)為0.736處，可將這38個新品種（系）劃分成兩個群體。其中，福農(nóng)09-2201和桂糖06-1492作為一個小群體被單獨(dú)劃分出來，說明兩個品種（系）在整個群體中具有較高的特異性。另外，在遺傳相似系數(shù)為0.770處劃分出一個包括參照品種R O C22在內(nèi)的子群體a，該群

6、體中還包括福農(nóng)07-3206、福農(nóng)40、海蔗22、桂糖09-12和柳城07-150等品種。R O C22作為當(dāng)前推廣面積最大的甘蔗品種，其高產(chǎn)、高糖、強(qiáng)宿根性等優(yōu)良特性已得到廣大種植戶的認(rèn)可。在品種推廣時，除了考慮推廣品種與主栽品種 R OC22的遺傳距離外，也需要考慮它與R OC22在產(chǎn)量和品質(zhì)性狀上的相似性，以此來獲得種植戶的認(rèn)可，增加其推廣的可能性。鑒于同一子群體中不同品種的遺傳相似性較高，這些品種更有可能獲得與 R OC22類似

7、的優(yōu)良特性，具有良好的推廣潛力。但是，在選擇與RO C22同時同地推廣的品種時，需要選擇與RO C22遺傳距離較遠(yuǎn)的品種，以增加甘蔗群體對不良環(huán)境的抗性。另外，還需要結(jié)合各品種實(shí)際的田間表現(xiàn)。
　　（4）本研究還根據(jù)所獲得的38個甘蔗品種DNA指紋數(shù)據(jù)，更新了課題組前期構(gòu)建的甘蔗DNA指紋數(shù)據(jù)庫。具體地，將本研究獲得的38個甘蔗新品種（系）S SR指紋數(shù)據(jù)錄入本實(shí)驗(yàn)室建立的甘蔗品種指紋數(shù)據(jù)庫中，并對數(shù)據(jù)庫中數(shù)據(jù)進(jìn)行整理，剔除重復(fù)錄