鯉魚遺傳圖譜構(gòu)建及其相關(guān)性狀的QTL檢測.pdf

1、采用磁珠富集法構(gòu)建鯉魚（Cyprinus carpio）三、四核苷酸重復(fù)微衛(wèi)星序列，設(shè)計并篩選出能夠在鯉魚基因組穩(wěn)定擴增和具有多態(tài)性的多個微衛(wèi)星標(biāo)記。利用這些微衛(wèi)星標(biāo)記，以在表型性狀上具有明顯差異的荷包紅鯉（Cyprinus carpio var.wananensis）抗寒品系和柏氏鯉（Cyprinus pellegnini pellegnini Tchang）的F2為作圖群體，構(gòu)建鯉魚遺傳連鎖圖譜并對乳酸脫氫酶（LDH）活性和超氧化物

2、歧化酶（SOD）活性性狀進行了QTL檢測。研究的主要結(jié)果如下： 1.鯉魚三、四核苷酸微衛(wèi)星引物的開發(fā) 采用磁珠富集法和放射性雜交相結(jié)合建鯉魚（Cyprinus carpio）三、四核苷酸重復(fù)微衛(wèi)星序列，設(shè)計并合成微衛(wèi)星引物145對，篩選出112對具有多態(tài)性和穩(wěn)定擴增的微衛(wèi)星引物。 2.遺傳連鎖圖譜的構(gòu)建 利用Onemap軟件對篩選出的202個多態(tài)性標(biāo)記進行連鎖分析，構(gòu)建出一個鯉魚連鎖圖譜。鯉魚連鎖圖譜有1

3、04個標(biāo)記（66個SSR，38個EST-SSR）定位到35個連鎖群上，其余98個標(biāo)記沒有定位到連鎖群上。該圖譜總長度為869.8cM，標(biāo)記間平均距離為12.61cM。每個連鎖群含2～13個標(biāo)記，連鎖群長度為0.6cM～151.8cM，各連鎖群平均圖距為0.55cM～30.1cM。 3.鯉魚乳酸脫氫酶（LDH）活性和超氧化物歧化酶（SOD）活性性狀進行了QTL檢測 通過多態(tài)性微衛(wèi)星標(biāo)記與乳酸脫氫酶（LDH）活性和超氧化物歧

4、化酶（SOD）活性性狀QTL檢測，結(jié)果表明：HLJE222等12個座位與乳酸脫氫酶（LDH）活性性狀顯著相關(guān)（P<0.05），可解釋的表型變異型為4.00％～10.00％，其中HUE222座位與該性狀極顯著相關(guān)（P<0.01），可解釋的表型變異型為10.00％；HLJE599和HLJ1496這2個座位與超氧化物歧化酶（SOD）活性性狀顯著相關(guān)（P<0.05），可解釋的表型變異型為4.00％～6.00％，說明這兩個座位可能與影響超氧化物歧

5、化酶（SOD）活性相關(guān)的基因連鎖。 4.檢測結(jié)果分析 利用已有的生物信息學(xué)工具，將相關(guān)的EST-SSR標(biāo)記與公共數(shù)據(jù)庫中的核酸序列以及已知蛋白序列進行同源搜索分析，結(jié)果發(fā)現(xiàn)與鯉魚乳酸脫氫酶活性極顯著相關(guān)的EST（HLJE222），與斑馬魚DAZassociatedprotein1，mRNA相匹配，DAZ蛋白是一種短鏈的脫氫酶，是生物體細(xì)胞內(nèi)糖代謝過程的重要酶。這說明此基因座與控制乳酸脫氫酶活性相關(guān)的基因連鎖，進一步證明本