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1、受人類基因組研究所取得的巨大進(jìn)展的影響和啟示,動(dòng)物基因組學(xué)的研究已展現(xiàn)出光輝燦爛的前景。與人類基因組研究不同,動(dòng)物基因組的研究與經(jīng)濟(jì)性狀有關(guān)的染色體區(qū)域、目標(biāo)是要精細(xì)定位畜禽中控制重要經(jīng)濟(jì)性狀位點(diǎn)在遺傳圖譜中的位置,并利用這些信息來改良畜禽品種。本文正是基于這樣的背景,采用微衛(wèi)星標(biāo)記,對(duì)雞進(jìn)行基因組掃描,尋找影響雞重要經(jīng)濟(jì)性狀的染色體區(qū)域,探索一條DNA分子標(biāo)記輔助選擇進(jìn)行動(dòng)物分子育種的途徑,并為構(gòu)建高密度的遺傳圖譜以及將來能夠進(jìn)行以圖
2、譜為基礎(chǔ)的基因型選擇奠定基礎(chǔ)。 本研究利用固始雞和安卡雞為試驗(yàn)素材建立參考家系,采用F2代設(shè)計(jì)方法,建立了正反交7個(gè)家系,849只性狀分離個(gè)體。在第三條染色體上選取了10對(duì)微衛(wèi)星標(biāo)記對(duì)這些個(gè)體進(jìn)行掃描。用Cervus2.0軟件分析結(jié)果顯示10個(gè)多態(tài)標(biāo)記的等位基因數(shù)為2-5個(gè),雜合度為0.483-0.706,多態(tài)信息含量為0.367-0.653。10個(gè)微衛(wèi)星標(biāo)記均有較高的多態(tài)信息含量,為該資源群體從分子水平上的研究提供了可靠的依據(jù)
3、。 對(duì)實(shí)驗(yàn)群體的的肉質(zhì)性狀表型數(shù)據(jù)、屠體性狀表型數(shù)據(jù)、生長性狀表型數(shù)據(jù)以及血液生化指標(biāo)進(jìn)行了描述統(tǒng)計(jì)分析。相關(guān)分析的結(jié)果表明各表型值存在一定程度的變異,為數(shù)量性狀QTL的定位提供了保障。 采用SAS統(tǒng)計(jì)軟件中的非均衡數(shù)據(jù)的方差分析對(duì)標(biāo)記座位與各性狀指標(biāo)間是否存在顯著性差異進(jìn)行了分析,檢測(cè)到的10個(gè)標(biāo)記中有7個(gè)標(biāo)記與肉質(zhì)性狀指標(biāo)間差異顯著;10個(gè)標(biāo)記與屠體性狀、生長性狀以及血液生化指標(biāo)間存在不同程度的相關(guān)。 用QT
4、LExpress在線分析軟件對(duì)各性狀間進(jìn)行QTL定位分析,QTL定位結(jié)果顯示:肉質(zhì)性狀檢測(cè)到了1個(gè)QTL,103cM處檢測(cè)到了影響脂肪含量的QTL。 生長性狀檢測(cè)到了20個(gè)QTL,分別為:143cM處檢測(cè)到了影響12周脛長的QTL;274cM處檢測(cè)到了影響8周胸深的QTL;104cM處檢測(cè)到了影響4周朐角和8周體斜長的QTL;253cM處檢測(cè)到了影響4周體斜長的QTL;103cM處檢測(cè)到了影響12周胸角的QTL;146cM處檢測(cè)
5、到了影響12周胸骨長和12周體斜長的QTL;243cM處檢測(cè)到了影響4周骨盆寬的QTL;255cM處檢測(cè)到了影響4周脛圍、8周脛圍、4周胸骨長、8周胸骨長以及0-12周體重的QTL; 屠體性狀檢測(cè)到了8個(gè)QTL,分別為:255cM處檢測(cè)到了影響全凈膛重、半凈膛重、胰腺重、胸肌重、腿肌重、屠體重的QTL;59cM處檢測(cè)到了影響翅重的QTL;111cM處檢測(cè)到了影響肌胃重的QTL; 血液生化指標(biāo)中檢測(cè)到了5個(gè)QTL,分別為:
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