高級生物化學試題_第1頁
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1、1為什么說蛋白質(zhì)的一級結構決定其高級結構?為什么說蛋白質(zhì)的一級結構決定其高級結構?一級結構也就是氨基酸序列,像是一些堿性氨基酸或是帶電荷氨基酸會對蛋白質(zhì)的2級結構產(chǎn)生決定性的作用,由于組成蛋白質(zhì)的20種氨基酸各具特殊的側鏈,側鏈基團的理化性質(zhì)和空間排布各不相同,當它們按照不同的序列關系組合時,就可形成多種多樣的空間結構和不同生物學活性的蛋白質(zhì)分子。比如脯氨酸經(jīng)常出現(xiàn)在肽鏈的折疊處;基酸的性質(zhì)決定了他們的疏水或親水,這樣折疊時親水的基團在

2、外,疏水的在內(nèi)。樣下來組成蛋白一級結構的氨基酸間形成像氫鍵、二硫鍵這樣的次級鍵,導致了蛋白2級結構的形成,如a折疊、b片層等。三級結構又是由2級結構所決定的,多個2級結構形成結構域,而4級結構又是由幾個3級結構組成的,所以說蛋白質(zhì)的一級結構決定了高級結構。2試論述蛋白質(zhì)二級結構的三種基本類型的特點有哪些試論述蛋白質(zhì)二級結構的三種基本類型的特點有哪些α螺旋螺旋蛋白質(zhì)中常見的一種二級結構,肽鏈主鏈繞假想的中心軸盤繞成螺旋狀,一般都是右手螺旋

3、結構,螺旋是靠鏈內(nèi)氫鍵維持的。每個氨基酸殘基(第n個)的羰基氧與多肽鏈C端方向的第4個殘基(第n4個)的酰胺氮形成氫鍵。在典型的右手α螺旋結構中,螺距為0.54nm,每一圈含有3.6個氨基酸殘基,每個殘基沿著螺旋的長軸上升0.15nm。螺旋的半徑為0.23nm。特點特點①肽鏈以螺旋狀盤卷前進,每圈螺旋由3.6個氨基酸構成,螺圈間距(螺距)為5.44埃;②螺旋結構被規(guī)則排布的氫鍵所穩(wěn)定,氫鍵排布的方式是:每個氨基酸殘基的N—H與其氨基側相

4、間三個氨基酸殘基的C=O形成氫鍵。這樣構成的由一個氫鍵閉合的環(huán),包含13個原子。因此,α螺旋常被準確地表示為3.613螺旋。螺旋的盤繞方式一般有右手旋轉(zhuǎn)和左手旋轉(zhuǎn),在蛋白質(zhì)分子中實際存在的是右手螺旋。β折疊折疊在β折疊中,兩條以上氨基酸鏈(肽鏈),或同一條肽鏈之間的不同部分形成平行或反平行排列,成為“股”。肽平面之間呈手風琴狀折疊,股與股之間會通過氫鍵固定,但氫鍵主要在股間而不是股內(nèi)。氨基酸殘基的R側鏈分布在片層的上下。β折疊層并不是平

5、的,因為側鏈的存在使得它看上去像手風琴一樣波紋起伏。這樣每一股會更緊密排列,氫鍵更容易建立。氫鍵的距離為7埃。在蛋白質(zhì)結構中β折疊通常會用箭頭表示。肽鏈的氮端在同側為順式,兩殘基間距為0.65nm;不在同側為反式,兩殘基間距為0.70nm。反式較順式平行折疊更加穩(wěn)定。能形成β折疊的氨基酸殘基一般不大,而且不帶同種電荷,這樣有利于多肽鏈的伸展,如甘氨酸、丙氨酸在β折疊中出現(xiàn)的幾率最高。β轉(zhuǎn)角轉(zhuǎn)角也是多肽鏈中常見的二級結構,連接蛋白質(zhì)分子中

6、的二級結構(α螺旋和β折疊),使肽鏈走向改變的一種非重復多肽區(qū),一般含有2~16個氨基酸殘基。含有5個氨基酸殘基以上的轉(zhuǎn)角又常稱之環(huán)(loops)。常見的轉(zhuǎn)角含有4個氨基酸殘基,有兩種類型。轉(zhuǎn)角I的特點是:第1個氨基酸殘基羰基氧與第4個殘基的酰胺氮之間形成氫鍵;轉(zhuǎn)角II的第3個殘基往往是甘氨酸。這兩種轉(zhuǎn)角中的第2個殘基大都是脯氨酸。?由四個連續(xù)的氨基酸殘基構成,主鏈骨架本身以大約180℃返回折迭。?第一個氨基酸殘基的CO與第四個氨基酸的

7、NH形成氫鍵,從而穩(wěn)定轉(zhuǎn)折的構象用化學方法水解核酸能夠得到什么產(chǎn)物取決于核酸分子中磷酸二酯鍵和N糖苷鍵對酸、堿的相對穩(wěn)定性。RNA中,核糖與堿基之間的N糖苷鍵對堿穩(wěn)定,RNA主鏈中的磷酸二酯鍵一般也對堿穩(wěn)定,因此RNA通常應該不被水解。但是,RNA分子由于核糖上有2′羥基,存在鄰接基團參與效應,在堿催化下,RNA分子中的磷?;l(fā)生轉(zhuǎn)移,生成2′,3′環(huán)狀單核苷酸中間產(chǎn)物,環(huán)核苷酸再進一步水解成2′核苷酸和3′核苷酸。DNA則一般不被堿水

8、解。堿水解RNA時,A、C、G、U、I、T的單核甘酸和幾種甲基化堿基是穩(wěn)定的,m1A轉(zhuǎn)變?yōu)閙6A,m3C轉(zhuǎn)變?yōu)閙3U,而m7G、m1I、tC6A、m6tC8A會被堿破壞。修飾組分2′O甲基核糖核苷酸由于不能形成2′,3′環(huán)核苷酸,因此該處的磷酸二酸鍵不被堿水解,產(chǎn)物中出現(xiàn)NmNp和NmNmNp等寡核苷酸。大腸桿菌16SrRNA中的m62Am62Ap也有很強的抗堿性,用1mol∕LNaOH,37℃水解9小時后仍有38%殘存,而通常RNA用

9、0.3mol∕LNaOH,37℃作用18小時即可完全水解。一噬菌體裂解途徑和溶源化途徑的調(diào)控噬菌體裂解途徑和溶源化途徑的調(diào)控①溶源途徑?噬菌體感染E.coli后,將其基因組整合到細菌染色體上,隨著細菌染色體的復制而復制。整合有噬菌體基因組的細菌稱為溶源菌,這一過程稱為溶源途徑。溶源化細菌一般不被同種噬菌體再行感染,這一現(xiàn)象稱為免疫性。②溶菌途徑?噬菌體感染宿主后也可以利用細菌細胞內(nèi)的養(yǎng)料進行繁殖,最終使宿主裂解而死亡,這一過程稱為溶菌途

10、徑。溶源化的細菌受某些外界物理或化學因素(如紫外線、絲裂霉素C等)的作用原噬茵體便脫離細菌染色體而進行自主復制,于是細菌裂解,游離出大量的噬菌體,這一過程稱為誘導。蛋白質(zhì)分離主要根據(jù)五種原理:分子大小、溶解度、電荷、吸附性質(zhì)、對配體分子的生物學親和力等。??DNA的基因表達調(diào)控的基因表達調(diào)控抗終止作用抗終止作用?Phage的轉(zhuǎn)錄調(diào)控決定了它的裂解途徑或溶原途徑,它于其它體系比較的最大特點在于抗終止??菇K止蛋白可解除弱終止子的作用而使轉(zhuǎn)錄

11、進行進行。如PN作用于tL1和tR1。PN在左操縱子上的作用部位稱為NutL(Nutilizationsite),PN在右操縱子上的作用部位為NutR,Nut緊鄰終止子處??菇K止蛋白結合于nut,當RNApol轉(zhuǎn)錄通過nut位點時,RNApol與nut位點的pN結合,使RNApol構象發(fā)生改變,而不為弱終止子終止。當nutL突變時,N不能抑制tL1位點的終止。說明N蛋白參與可抗終止(tL1和tR1),N蛋白為可擴散的堿性蛋白(14kD)

12、它識別特異的nut位點,故其不能使細菌轉(zhuǎn)錄終止。?噬菌體基因組調(diào)控區(qū)有6個啟動子,PL、PR1分別負責啟動向左向右的轉(zhuǎn)錄,PE、PM是轉(zhuǎn)錄CⅠ基因的兩個啟動子,PRE主管建立溶源(repressfestablishmentoflysogeny),PRM主管維持溶源(repressfmaintenanceoflysogeny)。PRE的啟動需要CⅡ、CⅢ蛋白,PI啟動轉(zhuǎn)錄int基因(整合酶),PI的起始也需要CⅡCⅢ蛋白,PR2(或PR’

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