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文檔簡介
1、隨著信息技術(shù)的快速發(fā)展以及醫(yī)療信息系統(tǒng)的逐步健全,醫(yī)療與每個人的日常生活已息息相關(guān),并產(chǎn)生了越來越多可利用的醫(yī)療大數(shù)據(jù)。在醫(yī)療領(lǐng)域,包括的醫(yī)療數(shù)據(jù)和信息類型非常廣泛,可以大致分為以下三種:臨床數(shù)據(jù)(Clinical Data)、體檢數(shù)據(jù)(Biometric Data)、醫(yī)保數(shù)據(jù)(Medicare Data)?;谏鲜鲠t(yī)療數(shù)據(jù)進(jìn)行風(fēng)險預(yù)測模型研究是當(dāng)今一個很熱的醫(yī)學(xué)研究趨勢,例如預(yù)測病人是否會患某種特定的疾病、預(yù)測病人未來會患不同疾病的概
2、率風(fēng)險等都屬于醫(yī)療風(fēng)險預(yù)測范疇。若可以利用醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)進(jìn)行有效的醫(yī)療風(fēng)險預(yù)測模型研究,則可以大大降低醫(yī)療浪費,從而提高醫(yī)療質(zhì)量,擁有更好的醫(yī)療服務(wù)。
病人的電子健康檔案(EHRs)以電子的形式系統(tǒng)性收集了病人在不同時間點的醫(yī)療健康信息,是指導(dǎo)數(shù)據(jù)驅(qū)動醫(yī)療研究的主要載體之一。鑒于原始EHRs數(shù)據(jù)的異構(gòu)性、稀疏性等特點,直接使用未加工的EHRs去指導(dǎo)個性化醫(yī)療是非常具有挑戰(zhàn)性的,因此,在進(jìn)行具體的疾病風(fēng)險預(yù)測應(yīng)用之前需要對原始EHRs
3、數(shù)據(jù)進(jìn)行一致性表示,將未加工的電子健康檔案數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)化為臨床相關(guān)的特征信息是一個值得研究的問題?,F(xiàn)已有一些工作基于EHRs數(shù)據(jù)提出了不同的預(yù)測方法,并對醫(yī)療數(shù)據(jù)進(jìn)行了一致性表示,但使用圖以及考慮不同醫(yī)療事件之間時序關(guān)系的表示形式研究的比較少,然而圖具有直觀易理解性并且時序關(guān)系能夠捕捉到疾病未來發(fā)展趨勢的重要信號,本文將上述兩點進(jìn)行結(jié)合,為每位病人構(gòu)建一個醫(yī)療時序圖,時序圖的表示形式壓縮了原始數(shù)據(jù)使其更緊湊,從而有效解決了醫(yī)療數(shù)據(jù)的稀疏性問題
4、,并且為每位病人的分散數(shù)據(jù)提供了一種全景概括視圖。
本文主要在不同類型的醫(yī)療數(shù)據(jù)下,基于構(gòu)建的病人時序圖,針對現(xiàn)有風(fēng)險預(yù)測工作存在的一些不足,對不同的醫(yī)療風(fēng)險預(yù)測模型進(jìn)行一系列研究。本文的具體工作和貢獻(xiàn)概括如下:
1.提出一種基于病人時序圖的疾病風(fēng)險預(yù)測方法(A Data-Driven Approach toPredictMedical Risk Based on Temporal Profile Graph,MTP
5、Graph)。首先對每位病人的原始電子健康檔案數(shù)據(jù)(EHRs)進(jìn)行一致性表示,即提出一種時序圖的表示形式;其次運用改進(jìn)的Apriori頻繁項集挖掘算法TRApriori,基于病人時序圖挖掘頻繁特征圖;根據(jù)圖的重構(gòu)原理,每位病人的時序圖可由時序特征圖重新構(gòu)成,最終獲得針對不同病人的重構(gòu)系數(shù)(即特征向量),對病人是否會患某種特定疾病進(jìn)行有效預(yù)測。通過對兩種真實臨床場景的實驗驗證并與傳統(tǒng)方法比較,結(jié)果顯示該疾病風(fēng)險預(yù)測方法可達(dá)到更好的預(yù)測效果
6、。
2.提出一種基于病人時序圖表示的協(xié)同評估預(yù)測模型(Collaborative PredictionModel of Disease Risk by Mining Electronic Health Records,CAPM),僅需依賴病人EHRs數(shù)據(jù)中的疾病ICD-10編碼來對病人未來會患不同疾病的概率風(fēng)險進(jìn)行預(yù)測。首先將每位病人的原始EHR數(shù)據(jù)表示為時序圖;其次提出一種混合協(xié)同過濾方法,基于個人醫(yī)療歷史記錄和與其相似病人
7、的醫(yī)療數(shù)據(jù)對每位病人的患病風(fēng)險進(jìn)行預(yù)測;另外,為了能夠進(jìn)行早期預(yù)防,提出一種計算對應(yīng)疾病開始時間的方法。通過在真實的EHR數(shù)據(jù)集上進(jìn)行的實驗,結(jié)果證明CAPM能更好的對病人未來會患哪些疾病及對應(yīng)疾病可能的開始時間進(jìn)行預(yù)測。
3.提出一種基于多類型醫(yī)療數(shù)據(jù)的疾病風(fēng)險預(yù)測模型。首先將病人的三類醫(yī)療數(shù)據(jù)(臨床EHRs、體檢數(shù)據(jù)、醫(yī)療保險數(shù)據(jù))進(jìn)行有序鏈接,為每位病人構(gòu)建一個醫(yī)療時序圖;其次提出改進(jìn)的AGM算法,基于所有病人的醫(yī)療時序
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