應(yīng)用ABEEM-MM方法研究ILE(H2O)n(n=1-3)團(tuán)簇的性質(zhì).pdf

1、異亮氨酸是人體必需氨基酸之一，在人類生命代謝中占有特別重要的地位，因而探討異亮氨酸與水分子之間的相互作用具有非常重要的意義。
　　 本論文中采用B3LYP/6—311++G(d，p)方法對(duì)研究體系進(jìn)行結(jié)構(gòu)優(yōu)化和頻率計(jì)算，在MP2/6—311++G(d，p)水平上進(jìn)行能量計(jì)算，對(duì)ILE—水團(tuán)簇的能量計(jì)算同時(shí)進(jìn)行了BSSE校正。首先研究了異亮氨酸單體的幾何構(gòu)型，得到10個(gè)相對(duì)穩(wěn)定構(gòu)型，結(jié)果表明最穩(wěn)定的兩個(gè)構(gòu)型是單體a和單體b，甩AB

2、EEM/MM模型對(duì)其進(jìn)行優(yōu)化和電荷分布分析，并與從頭算的計(jì)算結(jié)果進(jìn)行比較，擬合了一組比較理想的ILE—H2O勢(shì)能模型參數(shù)。其次研究了異亮氨酸與一個(gè)水的相互作用，通過(guò)分析氫鍵作用區(qū)域可知，能形成5種氫鍵類型，運(yùn)用ABEEM模型對(duì)ILE中氧原子和氮原子以及它們的孤對(duì)電子的電荷分布進(jìn)行分析，可以預(yù)測(cè)水在某一區(qū)域形成氫鍵的強(qiáng)弱，并用ABEEM/MM和從頭算方法計(jì)算穩(wěn)定二聚體的結(jié)合能，數(shù)據(jù)表明ABEEM/MM模型與從頭算方法得到的結(jié)果有很好的一致