無(wú)針紐蟲(chóng)線粒體基因組比較研究.pdf

1、基于線粒體基因組數(shù)據(jù)的系統(tǒng)發(fā)育分析已經(jīng)廣泛應(yīng)用在了許多動(dòng)物類(lèi)群上。已知紐形動(dòng)物約1280個(gè)物種，而只有14個(gè)線粒體基因組儲(chǔ)存在GenBank中。本文新報(bào)道了9種無(wú)針類(lèi)紐蟲(chóng)線粒體基因組，并聯(lián)合數(shù)據(jù)庫(kù)中已有的數(shù)據(jù)重建了紐形動(dòng)物門(mén)的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系。
　　新測(cè)出的紐形動(dòng)物線粒體基因組中，七個(gè)是異紐，分別是亨氏無(wú)溝紐蟲(chóng)（Baseodiscus hemprichii，全長(zhǎng)15205bp）、戈怪紐蟲(chóng)（Gogonorhynchus sp.，全長(zhǎng)15

2、334 bp）、美麗小尾紐蟲(chóng)（Micrura bella，全長(zhǎng)16847 bp）、血色喙紐蟲(chóng)（Ramphogordius sanguineus，全長(zhǎng)15322 bp）、環(huán)紋背睪紐蟲(chóng)（Notospermusgeniculatus，全長(zhǎng)15053 bp）、瀧氏離縱溝紐蟲(chóng)(Paralineopsis cf.taki，全長(zhǎng)為15134bp)和椒斑巖田紐蟲(chóng)（Iwatanemertes piperata，全長(zhǎng)16382 bp）。異紐類(lèi)紐蟲(chóng)的線粒體基

3、因組組成一致，編碼37個(gè)基因（包括13個(gè)蛋白質(zhì)編碼基因、兩個(gè)核糖體RNA基因和22個(gè)轉(zhuǎn)運(yùn)RNA基因）。六個(gè)紐蟲(chóng)的線粒體基因組與之前發(fā)表的異紐類(lèi)紐蟲(chóng)有著相同的基因順序，而戈怪紐蟲(chóng)線粒體基因組的兩個(gè)亮氨酸轉(zhuǎn)運(yùn)RNA的位置發(fā)生了互換。
　　古紐的井島小休氏紐蟲(chóng)（Hubrechtella ijimai）與斑管棲紐蟲(chóng)（Tubulanuspunctutus）的線粒體基因組長(zhǎng)度分別為15224bp和15307bp，它們的基因排列順序與其他紐蟲(chóng)較

4、大差異。井島小休氏紐蟲(chóng)的線粒體基因組編碼了38個(gè)基因，比大多數(shù)紐蟲(chóng)多了一個(gè)賴氨酸轉(zhuǎn)運(yùn)RNA基因。
　　現(xiàn)有數(shù)據(jù)得出的紐形動(dòng)物線粒體基因組平均長(zhǎng)度為15354 bp，針紐類(lèi)的平均長(zhǎng)度最短(14793bp)，古紐類(lèi)的平均長(zhǎng)度最長(zhǎng)(15657bp)，異紐類(lèi)的長(zhǎng)度居中(15567bp)。三大類(lèi)群中異紐類(lèi)的線粒體基因組AT含量最低(55.68％-66.03％)，其次為針紐類(lèi)(67.44％-71.17％)，最高為古紐類(lèi)(63.04％-75.7

5、8％)。對(duì)紐形動(dòng)物線粒體基因組的基因排列順序研究后發(fā)現(xiàn)異紐類(lèi)與其他類(lèi)群享有更多的基因塊。13個(gè)蛋白質(zhì)編碼基因均顯示出了純化選擇效應(yīng)（Ka/Ks＜1），cox1基因表現(xiàn)出最強(qiáng)的純化選擇，atp8基因則顯示出最弱的純化選擇。大部分tRNA基因都能形成典型的三葉草結(jié)構(gòu)，一些絲氨酸t(yī)RNA缺失了DHU臂。古紐類(lèi)和針紐類(lèi)的trnS(AGN)基因反密碼子是GCT，在異紐類(lèi)中通常是TCT，但本文新發(fā)表的異紐類(lèi)紐蟲(chóng)亨氏無(wú)溝紐蟲(chóng)為GCT。
　　基于