云南、河南兩省日本三角渦蟲基于mtDNA COI基因片段的分子系統(tǒng)學研究.pdf

1、本文利用PCR等技術對河南、云南兩省二十一產地淡水多目日本三角渦蟲線粒體DNA細胞色素C氧化酶Ⅰ亞基(cytochrome C oxidase subunit I,COI)基因進行PCR擴增、克隆和測序,通過生物信息學方法用Clustal X1.80和Mega4.0程序對其進行序列比對和系統(tǒng)樹構建,利用UPGMA、ME、NJ、MP統(tǒng)計軟件構建了支序圖,并對其系統(tǒng)進化關系進行了初步探討。
　　 結果：表明:UPGMA樹、ME樹、N

2、J樹、MP樹四種支序圖顯示的結果基本一致。其中,采自河南省大別山系商城縣的兩個種群XYshangcheng1和XYshangcheng2的COI片段序列同源性最高為一個聚類枝(Ⅱ);采自云南省四個城市的LClancang1、DLnanjianw11、Yxchengjiang和DLnanjianw12為一個大的聚類枝(Ⅰ);而采自河南省信陽固始的Xygushi和新鄉(xiāng)衛(wèi)輝的Xxweihui卻與云南省保山的Bsbanqiao和麗江的Ljyul

3、ongxueshan為一個聚類枝(Ⅲ);LClancang2、BSbanqiao2和Xyxinxian為一個聚類枝(Ⅳ)。但聚枝的先后順序在使用不同構樹方法時有差異,聚類枝(Ⅰ)和(Ⅱ)都與地理分布相一致,而聚類枝(Ⅲ)中的Xxweihui和聚類枝(Ⅳ)中的Xyxinxian與云南省其他種群聚為一枝。
　　 結果：提示:二十一產地日本三角渦蟲大部分在支序圖中的位置與其形態(tài)學資料反映出的系統(tǒng)演化關系一致,說明用線粒體DNA細胞色素