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1、人的抗原加工相關(guān)轉(zhuǎn)運(yùn)體(Transporter associated with antigen processing,TAP)是一種異源二聚的ABC轉(zhuǎn)運(yùn)復(fù)合體,負(fù)責(zé)篩選由蛋白酶體水解生成的內(nèi)源性抗原肽片段,并跨過(guò)內(nèi)質(zhì)網(wǎng)膜將其從胞漿中轉(zhuǎn)運(yùn)至內(nèi)質(zhì)網(wǎng)腔中,然后抗原肽得以同MHCI分子結(jié)合,繼而被呈遞至細(xì)胞表面,供免疫細(xì)胞識(shí)別,繼而引發(fā)免疫反應(yīng)。伴隨人們對(duì)于TAP基因的解碼以及對(duì)TAP分子在免疫應(yīng)答中所起作用的認(rèn)知,有關(guān)TAP分子同疾病關(guān)聯(lián)也得
2、到了進(jìn)一步的深入研究。近年來(lái)越來(lái)越多的研究證實(shí)TAP分子與多種慢性感染疾病、自身免疫疾病等密切相關(guān)。然而,在當(dāng)前缺乏高分辨率全長(zhǎng)TAP的3D結(jié)構(gòu)解析,TAP分子的結(jié)構(gòu)和功能、抗原肽的轉(zhuǎn)運(yùn)機(jī)制仍不清楚。
這里,我們基于同源建模方法,使用了Pgp-based-TAP-model2模型,然后利用拉伸分子動(dòng)力學(xué)的方法來(lái)模擬抗原轉(zhuǎn)運(yùn)機(jī)制,并獲得轉(zhuǎn)運(yùn)過(guò)程中膜蛋白TAP分子和抗原肽相互作用的各個(gè)結(jié)構(gòu)。通過(guò)分析轉(zhuǎn)運(yùn)過(guò)程體系的構(gòu)象變化,找出TA
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