3009.ll37抗菌肽段與膜相互作用的分子動力學(xué)模擬研究_第1頁
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1、碩士學(xué)位論文論文題目論文題目LL37抗菌肽段與膜相互作用的分子動力學(xué)模擬研究學(xué)科專業(yè)名稱:微生物學(xué)申請人姓名:毛文超指導(dǎo)教師:王吉華教授論文提交時間:2016年5月25日單位代碼10445學(xué)號2013020908分類號Q937研究生類別全日制碩士目錄目錄中文摘要.........................................................................................

2、...................................................IABSTRACT....................................................................................................................................III第一章緒論....................

3、.............................................................................................................11.1抗菌肽及其抗菌機制..................................................................................................

4、.........11.2抗菌肽LL37的結(jié)構(gòu)與功能...............................................................................................21.3抗菌肽LL37與膜的相互作用.................................................................................

5、.........21.4本文研究內(nèi)容........................................................................................................................4第二章分子動力學(xué)模擬......................................................................

6、..........................................62.1分子動力學(xué)模擬簡介...........................................................................................................62.2經(jīng)驗力場和GROMACS..........................................

7、............................................................72.3分子動力學(xué)模擬應(yīng)用于抗菌肽研究..................................................................................9第三章研究對象和方法................................................

8、..............................................................103.1模擬對象的選擇...................................................................................................................103.2膜平衡模擬.....................

9、.....................................................................................................113.3肽膜體系的模擬...........................................................................................................

10、.....12第四章研究結(jié)果及分析..............................................................................................................134.1模擬的收斂性..................................................................................

11、.....................................134.2肽段FK13的結(jié)構(gòu)特征.....................................................................................................144.2.1肽段FK13總體形態(tài)的變化..............................................

12、.......................................144.2.2FK13二級結(jié)構(gòu)（螺旋）形成情況........................................................................154.2.3FK13的典型結(jié)構(gòu)......................................................................

13、..................................154.3肽段FK13與膜的相互作用............................................................................................174.3.1肽段與膜的質(zhì)心之間的距離.........................................................

14、.............................174.3.2氫鍵的形成情況...........................................................................................................184.3.3系統(tǒng)的典型結(jié)構(gòu)........................................................

15、....................................................194.4膜的特征..............................................................................................................................214.4.1肽段在膜上的密度分布................

16、...............................................................................214.4.2脂質(zhì)的序參數(shù)................................................................................................................234.4.3膜厚度的變化...

17、.............................................................................................................24第五章總結(jié)與展望.....................................................................................................

18、.................27參考文獻.........................................................................................................................................30攻讀碩士學(xué)位期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文...........................................

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