深圳茅洲河及其流域胃腸炎患者Norovirus的監(jiān)測分析.pdf

1、目的:
　　（1）監(jiān)測茅洲河河水中諾如病毒（Norovirus，NoV）污染情況，并通過檢測河水中NoV，比較MCE-PEG和Pathatrix對河水中病毒的濃縮效果；
　　（2）監(jiān)測與分析深圳地區(qū)茅洲河流域胃腸炎散發(fā)病例和暴發(fā)疫情中NoV的分子流行病學(xué)特點；
　　（3）分析比較深圳地區(qū)茅洲河和流域內(nèi)散發(fā)和暴發(fā)的胃腸炎疫情中檢出的NoV同源關(guān)系，推斷是否存在NoV環(huán)境水體和人群之間循環(huán)傳播的可能性。
　　方法：<

2、br>　?。?）2014年3月至2015年2月，每月在茅洲河流域上下游定點采集的河水標(biāo)本各1L，河水標(biāo)本濃縮方式包括MCE-PEG和Pathatrix磁珠吸附法。兩種濃縮方式處理后，分別提取病毒RNA，通過real time RT-PCR和RT-PCR檢測的結(jié)果比較兩種濃縮方式的優(yōu)缺點。
　　（2）采集2014年3月-2015年2月流域內(nèi)胃腸炎患者的糞便標(biāo)本，糞便標(biāo)本來源包括哨點醫(yī)院采集的散發(fā)病例和區(qū)級疾病預(yù)防控制中心采集的暴發(fā)疫

3、情的病例。糞便標(biāo)本需加入 Hanks緩沖液稀釋離心后提取病毒 RNA，應(yīng)用real time RT-PCR初步確定GI和GII型，然后由RT-PCR擴增N/S片段后測序確定亞型；
　?。?）擴增出的NoV N/S片段，采用Clustal X比對，去除引物區(qū)域；系統(tǒng)進化分析采用Mega5.0軟件，使用Kimura2-parameter distance和Neibor-joining方法構(gòu)建系統(tǒng)進化樹。
　　結(jié)果：
　?。?/p>

4、1）上游和下游河水NoV檢出率差異無統(tǒng)計學(xué)意義(P>0.05)；
　　（2）2014年4-7月份和2015年1月份檢測NoV陽性；
　?。?）MCE-PEG處理河水后，GI和GII檢出率(25％，16.67%）分別高于Pathatrix(8.33%,0%)，P<0.05，差別有統(tǒng)計學(xué)意義；
　?。?）本研究共采集324份散發(fā)胃腸炎患者糞便標(biāo)本。0-1歲兒童感染NoV陽性率是20%，比其他年齡段高。GII.4y Sydn

5、ey_2012是流行株，其次是 GII.3。7-9月份為 GII.4 Sydney_2012的流行季節(jié)；
　　(5)2015年1月份暴發(fā)一起GII.3胃腸炎疫情，涉及20名＜5歲的兒童，與散發(fā)病例中GII.3 N/S片段基因同源性為99.5%；
　　(6)茅洲河NoV主要是GI.6型，其次是GII.4 Sydney_2012型。同時期水體和散發(fā)人群糞便標(biāo)本來源的NoVGII.4 Sydney_2012型N/S片段基因同源性為

6、98.2%?100.0%。
　　結(jié)論：
　?。?）初次在茅洲河中檢測到NoV GI.6和GII.4 Sydney_2012；
　?。?）MCE-PEG比Pathatrix對于河水中NoV的濃縮效果更明顯，檢出率更高；
　?。?）深圳地區(qū)5歲以下兒童為NoV的易感人群，尤其是0‐1歲屬于高危人群，流行季節(jié)為7‐9月；
　?。?）2014-2015年，NoVGII.4 Sydney_2012型是深圳地區(qū)胃腸炎人