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文檔簡介
1、隨著生物基因組計(jì)劃的相繼完成和全面實(shí)施，產(chǎn)生了越來越多的分子序列數(shù)據(jù)，生物學(xué)研究的重點(diǎn)也從數(shù)據(jù)積累向數(shù)據(jù)分析和解釋過渡。生物信息學(xué)便在這種背景下應(yīng)運(yùn)而生。它研究的內(nèi)容和領(lǐng)域非常豐富，其中大多數(shù)領(lǐng)域的研究工作都是對這些分子序列給出合理的數(shù)學(xué)描述。近二十多年來，DNA和蛋白質(zhì)序列的數(shù)學(xué)描述在研究生物序列的比較分析中的作用越來越大，并且與之相對應(yīng)的數(shù)值特征及相似性分析也相繼提出。論文在DNA和蛋白質(zhì)序列的數(shù)學(xué)表示、相似性分析和進(jìn)化樹的構(gòu)造等方
2、面進(jìn)行研究，主要工作包括： 在對DNA和蛋白質(zhì)序列的數(shù)學(xué)表示方法進(jìn)行較為詳細(xì)的綜述后，提出了一種基于雙核苷酸的DNA序列2D圖形表示方法，利用核苷酸的分類給出了序列的分布曲線圖形表示。根據(jù)圖形表示的特點(diǎn)構(gòu)造出新的協(xié)方差矩陣CM，然后從矩陣中提取出2維特征向量來代表物種的信息量。通過對11個物種的β-球蛋白基因全編碼序列的實(shí)驗(yàn)分析，驗(yàn)證了方法的有效性。 給出基于新的氨基酸分類的蛋白質(zhì)序列5D表示方法，進(jìn)而在數(shù)學(xué)表示的基
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