DNA序列的圖形表示及其相似性分析.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、近二十年來，DNA序列的圖形表示方法在研究DNA序列局部和整體的比較分析中的作用越來越大，并且與之相對應(yīng)的數(shù)值特征及相似性分析使這些直觀的視覺感知更加理性化。 在本篇論文中，首先給出了一個關(guān)于DNA序列的圖形表示方法較為詳細(xì)的綜述，其中先從3維表示方法入手，然后根據(jù)退化性的有無對2維表示方法進(jìn)行了介紹，并給出了一種基于3條特征曲線的新的2維圖形方法。然而，本文的中心內(nèi)容并不僅是對圖形表示方法的研究，而從基于圖形表示的數(shù)值特征向量

2、去進(jìn)行DNA序列之間的相似性分析。在接下來的三、四章中，通過上一章給出的新圖形方法和Yau的圖形表示法本文得到了Q矩陣，并利用Q矩陣的標(biāo)準(zhǔn)化主特征值得到三種表示DNA序列的數(shù)值特征向量方法。根據(jù)向量之間的歐氏距離，本文分析了11種生物的β-globin基因的第一外顯子序列的相似性，并同其它文獻(xiàn)中的相似性分析的結(jié)果進(jìn)行了比較。最后，作為DNA序列比較的一種參照，本文從最長公共子序列的角度考慮了DNA序列的相似性分析，并進(jìn)行了簡單的討論。其

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