DNA序列的二維圖形表示及應用.pdf

1、隨著人類基因組計劃的完成,生命科學領域也進入了后基因時代。而基因和蛋白質也成為生命科學研究的重點之一。過去,生物科學家們關注的是單一的基因或蛋白質?，F在,尤其是將來,科學家們將把工作的重心放在DNA序列信息,蛋白質結構信息,以及他們的相關關系上面。為了在不同層面和角度描述生物信息,很多科學家進行了基因和蛋白質統(tǒng)計關系以及數學關聯(lián)問題的研究,生物信息學的飛速發(fā)展給科學家們帶來的新的挑戰(zhàn)。計算分子生物學主要用于研究這些內容。計算分子生物學是

2、一門交叉學科,涵蓋數學、計算機、生物科學。其主要研究內容為基因與蛋白質序列的相互聯(lián)合關系。其核心內容就是序列比對、序列分析、生物信息數據庫、基因識別、進化樹的構建以及生物分子結構預測等等。
　　 隨著人類研究生命科學技術不斷進行,不斷有新的分子序列數據被產生出來了,同時它們又推動生物信息學的發(fā)展對這些序列數據進行科學的分析、處理可以。序列分析是生物信息學中的基本操作,通過分析序列之間的相似性可以預測它們之間的結構和功能關系。本文

3、將在圖形表達的基礎上對DNA序列進行進化分析研究。圖形表達是序列分析的重要方法。DNA序列的圖形表示方法為研究DNA序列提供了重要手段,利用圖形表示方法描述基因序列具有直觀性和計算簡單等優(yōu)點,這樣相對于傳統(tǒng)的研究方法,大大縮短研究的進程。
　　 本文我們提出一種基于蛋白質中的20種氨基酸和一個終止代碼,也即核苷酸三聯(lián)體的DNA二維圖形表達方法,對序列進行形象而直觀的描述。在這種二維圖形表達的基礎上,對序列進行相似性分析,并運用U